35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2953 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2953  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00176502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02719  probable putative transmembrane protein  42.05 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0076  hypothetical protein  33.99 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2385  hypothetical protein  34.96 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.370003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0508  putative transmembrane protein  34.63 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2062  hypothetical protein  35.84 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1031  putative transmembrane protein  35.98 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.14638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3356  hypothetical protein  33.64 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000221362  hitchhiker  0.00000177169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1231  hypothetical protein  32.25 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000281184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0858  putative transmembrane protein  34.36 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4317  putative transmembrane protein  36.57 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0407  hypothetical protein  31.34 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851089  normal  0.0723479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0465  putative transmembrane protein  32.89 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0011983  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2566  hypothetical protein  32.71 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000598494  normal  0.490219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3449  putative transmembrane protein  34.1 
 
 		 224 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0669267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0603  hypothetical protein  31.52 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00959677  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3743  putative transmembrane protein  30.74 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0364  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0428854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3024  putative transmembrane protein  30.74 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.931327  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0379  putative transmembrane protein  30.37 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2864  putative putative transmembrane protein  30.83 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0488  putative transmembrane protein  30.43 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2707  hypothetical protein  33.02 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0643  hypothetical protein  33.02 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0885  putative transmembrane protein  33.98 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.968622 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2608  hypothetical protein  32.59 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1198  hypothetical protein  32.59 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0337  hypothetical protein  32.59 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0676  hypothetical protein  32.56 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3381  hypothetical protein  32.59 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125971  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0193  hypothetical protein  32.56 
 
 		 242 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.502309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2421  hypothetical protein  32.59 
 
 		 377 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3416  hypothetical protein  32.59 
 
 		 371 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.630747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3423  hypothetical protein  32.59 
 
 		 371 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1387  putative transmembrane protein  34.36 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>