35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02719 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02719  probable putative transmembrane protein  100 
 
 		 297 aa  622  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2953  hypothetical protein  42.05 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2566  hypothetical protein  32.34 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000598494  normal  0.490219 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3356  hypothetical protein  32.77 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000221362  hitchhiker  0.00000177169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0076  hypothetical protein  31.98 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0603  hypothetical protein  30.4 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00959677  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0508  putative transmembrane protein  32.71 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2385  hypothetical protein  32.9 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.370003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0407  hypothetical protein  31.44 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851089  normal  0.0723479 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2062  hypothetical protein  32.31 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2864  putative putative transmembrane protein  31.8 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1231  hypothetical protein  32.09 
 
 		 354 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000281184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0858  putative transmembrane protein  33.64 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4317  putative transmembrane protein  29.43 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0488  putative transmembrane protein  29.91 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2421  hypothetical protein  31.16 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3423  hypothetical protein  31.63 
 
 		 371 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0337  hypothetical protein  31.13 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1198  hypothetical protein  31.13 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3416  hypothetical protein  31.63 
 
 		 371 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.630747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2608  hypothetical protein  31.13 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0885  putative transmembrane protein  31.02 
 
 		 262 aa  89.4  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.968622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0465  putative transmembrane protein  29.36 
 
 		 266 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0011983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3381  hypothetical protein  31.63 
 
 		 280 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3024  putative transmembrane protein  31.34 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.931327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3743  putative transmembrane protein  30.34 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1031  putative transmembrane protein  33.18 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.14638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0364  putative transmembrane protein  30.05 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0428854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0379  putative transmembrane protein  28.84 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3449  putative transmembrane protein  30.45 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0669267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0643  hypothetical protein  30.23 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2707  hypothetical protein  31.65 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0676  hypothetical protein  29.77 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0193  hypothetical protein  29.82 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.502309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1387  putative transmembrane protein  29.73 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>