35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0488 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0488  putative transmembrane protein  100 
 
 		 270 aa  537  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0364  putative transmembrane protein  72.97 
 
 		 266 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0428854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0379  putative transmembrane protein  75.78 
 
 		 265 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0494344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0465  putative transmembrane protein  57.41 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0011983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0407  hypothetical protein  54.44 
 
 		 262 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851089  normal  0.0723479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2566  hypothetical protein  49.45 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000598494  normal  0.490219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0603  hypothetical protein  51.89 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00959677  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3356  hypothetical protein  50.38 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000221362  hitchhiker  0.00000177169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2707  hypothetical protein  54.21 
 
 		 293 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0643  hypothetical protein  54.07 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00208458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0676  hypothetical protein  54.07 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0193  hypothetical protein  57.52 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.502309  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1231  hypothetical protein  52.87 
 
 		 354 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000281184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2421  hypothetical protein  52.69 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2608  hypothetical protein  52.69 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1198  hypothetical protein  52.69 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0337  hypothetical protein  52.69 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3423  hypothetical protein  52.65 
 
 		 371 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3381  hypothetical protein  53.03 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3416  hypothetical protein  52.65 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.630747  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3024  putative transmembrane protein  48.25 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.931327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3743  putative transmembrane protein  48.25 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1031  putative transmembrane protein  47.55 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.14638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4317  putative transmembrane protein  45.63 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0858  putative transmembrane protein  47.51 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2062  hypothetical protein  37.62 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1387  putative transmembrane protein  44.78 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2385  hypothetical protein  40.99 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.370003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3449  putative transmembrane protein  47.25 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0669267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0508  putative transmembrane protein  35.85 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0885  putative transmembrane protein  37.94 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.968622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0076  hypothetical protein  41.52 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2864  putative putative transmembrane protein  38.94 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2953  hypothetical protein  30.8 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00176502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02719  probable putative transmembrane protein  30.36 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>