21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1185 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1185  metal ion efflux membrane fusion protein family  100 
 
 		 354 aa  703    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0184  hypothetical protein  37.05 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1631  hypothetical protein  31.54 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0386768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0080  hypothetical protein  35.81 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.523588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2878  hypothetical protein  31.41 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0688135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3708  hypothetical protein  31.01 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000492742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3341  hypothetical protein  32.35 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1298  putative multidrug resistant protein  27.37 
 
 		 314 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5033  hypothetical protein  30 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.317146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4521  hypothetical protein  30.48 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.535871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4981  hypothetical protein  30.48 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  0.161388 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3109  hypothetical protein  30.53 
 
 		 308 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 		 530 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11703  putative cation efflux system transmembrane protein  36.07 
 
 		 578 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.728459  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  26.62 
 
 		 419 aa  46.2  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7202  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.33 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  32.57 
 
 		 374 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.08 
 
 		 575 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1330  hypothetical protein  39.58 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.060147  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  30.36 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.34 
 
 		 378 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>