20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1298 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1298  putative multidrug resistant protein  100 
 
 		 314 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2878  hypothetical protein  57.24 
 
 		 368 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0688135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3708  hypothetical protein  56.62 
 
 		 368 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000492742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4981  hypothetical protein  53.87 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  0.161388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4521  hypothetical protein  53.87 
 
 		 368 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.535871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5033  hypothetical protein  53.2 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.317146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3341  hypothetical protein  53.22 
 
 		 369 aa  299  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0184  hypothetical protein  33.78 
 
 		 375 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1631  hypothetical protein  32.67 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0386768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0080  hypothetical protein  32.3 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.523588  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1185  metal ion efflux membrane fusion protein family  27.56 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3109  hypothetical protein  24.17 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  22.71 
 
 		 384 aa  49.3  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7202  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.32 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00231  membrane fusion protein  26.36 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  43.33 
 
 		 427 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1589  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.6 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35 
 
 		 451 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  30.12 
 
 		 416 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  30.99 
 
 		 397 aa  42.7  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>