15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2878 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2878  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  727    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0688135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3708  hypothetical protein  85.87 
 
 		 368 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000492742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5033  hypothetical protein  61.1 
 
 		 368 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.317146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4521  hypothetical protein  68.32 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.535871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4981  hypothetical protein  68.32 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  0.161388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3341  hypothetical protein  63.82 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1298  putative multidrug resistant protein  57.63 
 
 		 314 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1631  hypothetical protein  31.61 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0386768 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0184  hypothetical protein  33.01 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1185  metal ion efflux membrane fusion protein family  30.98 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0080  hypothetical protein  31.62 
 
 		 300 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.523588  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3109  hypothetical protein  28.37 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0793  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.84 
 
 		 390 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2950  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 569 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 575 aa  42.7  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>