24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0470 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0470  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0304646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1188  exodeoxyribonuclease V, gamma subunit  100 
 
 
1354 aa  227  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.572849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1388  hypothetical protein  92.73 
 
 
115 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1591  hypothetical protein  63.74 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00589493  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1384  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1771  hypothetical protein  29.03 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0430779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  33.12 
 
 
737 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3489  hypothetical protein  40.96 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65511  normal  0.02619 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  47.44 
 
 
374 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  33.77 
 
 
650 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0359  hypothetical protein  54.24 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0572296  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  32.94 
 
 
2095 aa  51.2  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0011  putative outer membrane protein  31.03 
 
 
279 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  73.17 
 
 
876 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  32.84 
 
 
810 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0273  membrane protein-like protein  34.31 
 
 
982 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0125327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1241  hypothetical protein  51.46 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0655211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2069  phosphotransferase enzyme family protein  59.26 
 
 
142 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138746  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0589  adhesin  31.08 
 
 
386 aa  42.4  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  31.51 
 
 
1434 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  32.24 
 
 
2392 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6042  ribosomal large subunit pseudouridine synthase B  27.97 
 
 
228 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  52 
 
 
758 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1386  hypothetical protein  54.65 
 
 
487 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>