45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0641 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2455  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  98.28 
 
 
408 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0349208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0929  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  100 
 
 
427 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.604577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1187  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase domain-containing protein  98.6 
 
 
430 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0440226  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1261  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase domain-containing protein  98.83 
 
 
427 aa  829    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0641  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.453746  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0363  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  100 
 
 
427 aa  842    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1547  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  69.79 
 
 
272 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3507  hypothetical protein  79.19 
 
 
179 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3990  hypothetical protein  80.72 
 
 
179 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4270  hypothetical protein  76.47 
 
 
174 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4096  hypothetical protein  76.47 
 
 
174 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.41612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3427  hypothetical protein  75.44 
 
 
174 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4491  hypothetical protein  78.53 
 
 
178 aa  264  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.959725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1949  hypothetical protein  76.65 
 
 
174 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.285609  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2554  hypothetical protein  64.47 
 
 
168 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2911  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  65.79 
 
 
161 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.264333  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3315  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  46.95 
 
 
162 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3220  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  43.87 
 
 
169 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2872  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  38.51 
 
 
163 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1548  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  86.21 
 
 
408 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1480  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  33.55 
 
 
158 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3173  hypothetical protein  32.88 
 
 
150 aa  90.1  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3428  extracellular ligand-binding receptor  55.17 
 
 
388 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4271  extracellular ligand-binding receptor  56.9 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4095  extracellular ligand-binding receptor  56.9 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1950  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.17 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4492  extracellular ligand-binding receptor  53.45 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3506  extracellular ligand-binding receptor  51.67 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  50 
 
 
388 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  39.08 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4469  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.02 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05020  hypothetical protein  37.84 
 
 
107 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0360  hypothetical protein  41.89 
 
 
222 aa  46.6  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5315  extracellular ligand-binding receptor  45 
 
 
599 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.568135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3052  extracellular ligand-binding receptor  45 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  35.38 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  32 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2678  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.67 
 
 
383 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  33.85 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4954  extracellular ligand-binding receptor  43.33 
 
 
376 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3474  extracellular ligand-binding receptor  30.67 
 
 
383 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4047  extracellular ligand-binding receptor  30.67 
 
 
383 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  30.99 
 
 
393 aa  43.9  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  34.85 
 
 
382 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>