25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2911 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2911  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  100 
 
 
161 aa  328  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.264333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2554  hypothetical protein  65.16 
 
 
168 aa  216  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1547  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  65.38 
 
 
272 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3507  hypothetical protein  63.06 
 
 
179 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2455  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  65.79 
 
 
408 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0349208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0363  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  65.79 
 
 
427 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0641  hypothetical protein  65.79 
 
 
427 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.453746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0929  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  65.79 
 
 
427 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.604577  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3990  hypothetical protein  63.06 
 
 
179 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4491  hypothetical protein  62.42 
 
 
178 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.959725 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1187  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase domain-containing protein  65.79 
 
 
430 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0440226  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1261  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase domain-containing protein  65.79 
 
 
427 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1949  hypothetical protein  61.39 
 
 
174 aa  201  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.285609  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3427  hypothetical protein  62.09 
 
 
174 aa  197  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4096  hypothetical protein  62.09 
 
 
174 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.41612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4270  hypothetical protein  62.09 
 
 
174 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3315  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  49.01 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537977  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2872  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  44.52 
 
 
163 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3220  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  46.36 
 
 
169 aa  120  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1480  L-2-amino-thiazoline-4-carboxylic acid hydrolase  39.07 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3173  hypothetical protein  34.25 
 
 
150 aa  103  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0018  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.215123  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25510  hypothetical protein  27.85 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0049  hypothetical protein  27.98 
 
 
202 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0568  hypothetical protein  34.78 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>