76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0897 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0707  hypothetical protein  100 
 
 
717 bp  1421    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.445459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1818  hypothetical protein  99.71 
 
 
1578 bp  1330    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0453  hypothetical protein  100 
 
 
717 bp  1421    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1425  hypothetical protein  100 
 
 
717 bp  1421    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1639  major facilitator superfamily permease  99.71 
 
 
1614 bp  1330    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1662  major facilitator superfamily permease  99.41 
 
 
1641 bp  1314    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2659  major facilitator transporter  91.9 
 
 
1623 bp  712    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0897    100 
 
 
717 bp  1421    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.139641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1904  hypothetical protein  81.28 
 
 
1314 bp  109  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  83.13 
 
 
1230 bp  107  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  84.56 
 
 
1227 bp  103  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  79.34 
 
 
1266 bp  89.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  83.09 
 
 
1242 bp  87.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1389  hypothetical protein  82.35 
 
 
1263 bp  83.8  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290756 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0066  hypothetical protein  97.83 
 
 
972 bp  83.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.502649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1411  hypothetical protein  83.06 
 
 
1320 bp  79.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0929  hypothetical protein  83.06 
 
 
1263 bp  79.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0697566  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0281  putative threonine dehydratase  100 
 
 
510 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2027    100 
 
 
540 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3067    100 
 
 
540 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2413    97.67 
 
 
507 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1315  threonine dehydratase  100 
 
 
510 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.466157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0962  putative lipoprotein  100 
 
 
591 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0580    97.67 
 
 
507 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00482499  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0289  monooxygenase, truncation  100 
 
 
627 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0090242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0026  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  97.67 
 
 
507 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2258    100 
 
 
489 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0112  hypothetical protein  100 
 
 
285 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000008597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0286    97.67 
 
 
507 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1173  hypothetical protein  100 
 
 
801 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1306  monooxygenase, truncation  100 
 
 
612 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.817075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  82.22 
 
 
1254 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3392    100 
 
 
540 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.70718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3008  putative lipoprotein  100 
 
 
531 bp  77.8  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3325  C4-dicarboxylate transport protein  100 
 
 
618 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.983039  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3353  hypothetical protein  100 
 
 
255 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1566  putative lipoprotein  100 
 
 
669 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2085    100 
 
 
239 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.270809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  100 
 
 
693 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2047    100 
 
 
1143 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.275545  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1952  hypothetical protein  100 
 
 
123 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.681576  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  100 
 
 
621 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2799  YD repeat-containing protein  100 
 
 
375 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0415  hypothetical protein  100 
 
 
702 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0813  hypothetical protein  100 
 
 
303 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.183818  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3031  hypothetical protein  100 
 
 
669 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0497    100 
 
 
672 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108496  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0780    100 
 
 
1143 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1241  C4-dicarboxylate transport protein 3  100 
 
 
618 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1011  integrase  100 
 
 
672 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2226  hypothetical protein  100 
 
 
2547 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1787  alkyl hydroperoxide reductase, subunit f, truncation  100 
 
 
1143 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0619  putative purine permease YgfU  100 
 
 
543 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.353499  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  100 
 
 
693 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  100 
 
 
621 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2667  integrase  100 
 
 
1014 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.320055  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1168  putative DNA-binding protein  100 
 
 
594 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1073    100 
 
 
1143 bp  75.8  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.707638  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1313  major facilitator transporter  90.16 
 
 
1515 bp  73.8  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776247  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  92.5 
 
 
1272 bp  56  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  100 
 
 
1218 bp  52  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase II, putative  100 
 
 
1227 bp  50.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3655  aspartate kinase  96.55 
 
 
1164 bp  50.1  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.190051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3729  aspartate kinase  96.55 
 
 
1164 bp  50.1  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0398  hypothetical protein  100 
 
 
654 bp  50.1  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0534  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
1137 bp  50.1  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.0000192772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3589  aspartate kinase  96.55 
 
 
1164 bp  50.1  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3842  hypothetical protein  100 
 
 
2082 bp  48.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1398  putative methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
1668 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0501  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  100 
 
 
1677 bp  48.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0968  methyl-accepting chemotaxis transducer  100 
 
 
1677 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0217  putative methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
1677 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482038  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0254  putative methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
1641 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1595  putative methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
1668 bp  48.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2542  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
1641 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2687  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
1641 bp  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>