24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1241 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  99.51 
 
 
206 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  99.51 
 
 
206 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0116  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  357  8e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215371  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0637  hypothetical protein  89.29 
 
 
644 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6903  hypothetical protein  83.93 
 
 
646 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1566  putative lipoprotein  93.44 
 
 
222 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3031  hypothetical protein  93.44 
 
 
222 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0415  hypothetical protein  98.21 
 
 
233 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1787  alkyl hydroperoxide reductase, subunit f, truncation  98.21 
 
 
380 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0962  putative lipoprotein  93.44 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3008  putative lipoprotein  93.44 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1173  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2226  hypothetical protein  98.21 
 
 
848 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319982  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5268  hypothetical protein  35.91 
 
 
592 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3171  hypothetical protein  32.34 
 
 
539 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01939  putative transmembrane protein  36.24 
 
 
497 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44910  hypothetical protein  36.18 
 
 
569 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00907398  normal  0.870076 
 
 
-
 
NC_003296  RS05220  hypothetical protein  36.42 
 
 
612 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00396  hypothetical protein  34.87 
 
 
569 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0648901  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0290  hypothetical protein  28.26 
 
 
685 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  41.07 
 
 
189 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01972  ISXo8 transposase  37.93 
 
 
191 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0687025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>