45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA3008 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0962  putative lipoprotein  100 
 
 
196 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3008  putative lipoprotein  100 
 
 
176 aa  352  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3031  hypothetical protein  98.86 
 
 
222 aa  348  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1566  putative lipoprotein  98.86 
 
 
222 aa  348  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1102  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1261  putative lipoprotein  100 
 
 
203 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1107  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0861626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0899  putative lipoprotein  93.33 
 
 
223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5721  hypothetical protein  81.67 
 
 
200 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2399  hypothetical protein  80 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0224059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1783  hypothetical protein  80 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2395  hypothetical protein  80 
 
 
196 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0895  hypothetical protein  80 
 
 
183 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2440  hypothetical protein  80 
 
 
196 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2304  hypothetical protein  80.83 
 
 
196 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2226  hypothetical protein  83.82 
 
 
848 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.319982  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0097  hypothetical protein  93.44 
 
 
206 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1521  hypothetical protein  93.44 
 
 
206 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0081  hypothetical protein  93.44 
 
 
230 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.753199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1241  hypothetical protein  93.44 
 
 
230 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0415  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1173  hypothetical protein  98.21 
 
 
266 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198365  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1787  alkyl hydroperoxide reductase, subunit f, truncation  100 
 
 
380 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3380  hypothetical protein  77.78 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1132  hypothetical protein  76.53 
 
 
192 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2153  hypothetical protein  79.35 
 
 
170 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000351838 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5762  hypothetical protein  52.63 
 
 
178 aa  94.7  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3844  hypothetical protein  58.95 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4921  hypothetical protein  58.95 
 
 
164 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3381  hypothetical protein  36.26 
 
 
203 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0894  hypothetical protein  30.52 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433345  hitchhiker  0.0055981 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2154  hypothetical protein  31.69 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000384981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2305  hypothetical protein  34 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.720467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1131  hypothetical protein  36.26 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2441  hypothetical protein  34 
 
 
164 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2400  hypothetical protein  32 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  normal  0.0397764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1784  hypothetical protein  32 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2396  hypothetical protein  32 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5722  hypothetical protein  33.01 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  41.82 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1260  putative lipoprotein  32.97 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1106  putative lipoprotein  32.97 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0298305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1101  putative lipoprotein  32.97 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0898  putative lipoprotein  35.38 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01972  ISXo8 transposase  38.18 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0687025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>