38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1783 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2399  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0224059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2395  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1783  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5721  hypothetical protein  96.94 
 
 
200 aa  362  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2304  hypothetical protein  94.39 
 
 
196 aa  333  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2440  hypothetical protein  94.39 
 
 
196 aa  333  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0895  hypothetical protein  91.8 
 
 
183 aa  297  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547961 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1261  putative lipoprotein  78.76 
 
 
203 aa  269  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0899  putative lipoprotein  80.11 
 
 
223 aa  269  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1102  hypothetical protein  78.76 
 
 
222 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1107  hypothetical protein  78.76 
 
 
222 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0861626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3380  hypothetical protein  75.6 
 
 
192 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1132  hypothetical protein  78.34 
 
 
192 aa  203  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2153  hypothetical protein  77.42 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000351838 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5762  hypothetical protein  58.08 
 
 
178 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3844  hypothetical protein  57.58 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4921  hypothetical protein  57.58 
 
 
164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1566  putative lipoprotein  79.37 
 
 
222 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3031  hypothetical protein  79.37 
 
 
222 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0962  putative lipoprotein  80.49 
 
 
196 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3008  putative lipoprotein  80 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0894  hypothetical protein  39.39 
 
 
164 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433345  hitchhiker  0.0055981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2441  hypothetical protein  43.51 
 
 
164 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2305  hypothetical protein  43.51 
 
 
164 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.720467 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2396  hypothetical protein  38.79 
 
 
164 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1784  hypothetical protein  38.79 
 
 
164 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2400  hypothetical protein  38.79 
 
 
164 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  normal  0.0397764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5722  hypothetical protein  38.79 
 
 
164 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0898  putative lipoprotein  39.69 
 
 
168 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1260  putative lipoprotein  36.94 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1101  putative lipoprotein  36.94 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1106  putative lipoprotein  39.69 
 
 
168 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0298305  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2154  hypothetical protein  39.33 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000384981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1131  hypothetical protein  39.55 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3381  hypothetical protein  39.55 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5763  hypothetical protein  34.86 
 
 
168 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4922  hypothetical protein  33.95 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.874028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3845  hypothetical protein  33.95 
 
 
162 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.538934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>