39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1784 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2400  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  normal  0.0397764 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2396  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1784  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  328  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5722  hypothetical protein  94.51 
 
 
164 aa  290  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0894  hypothetical protein  92.68 
 
 
164 aa  285  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433345  hitchhiker  0.0055981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2305  hypothetical protein  96.95 
 
 
164 aa  278  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.720467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2441  hypothetical protein  96.34 
 
 
164 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1106  putative lipoprotein  84.14 
 
 
168 aa  225  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0298305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1260  putative lipoprotein  83.45 
 
 
168 aa  223  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1101  putative lipoprotein  83.45 
 
 
168 aa  223  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0898  putative lipoprotein  81.94 
 
 
168 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1131  hypothetical protein  66.06 
 
 
189 aa  198  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2154  hypothetical protein  66.47 
 
 
184 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000384981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3381  hypothetical protein  66.06 
 
 
203 aa  196  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5763  hypothetical protein  45.91 
 
 
168 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5762  hypothetical protein  46.03 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3845  hypothetical protein  41.77 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.538934 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4922  hypothetical protein  41.77 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.874028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3844  hypothetical protein  45.67 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4921  hypothetical protein  45.67 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3380  hypothetical protein  39.05 
 
 
192 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1132  hypothetical protein  39.38 
 
 
192 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5721  hypothetical protein  40.61 
 
 
200 aa  103  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2153  hypothetical protein  43.51 
 
 
170 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000351838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1783  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2399  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0224059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2395  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0895  hypothetical protein  41.98 
 
 
183 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2304  hypothetical protein  41.22 
 
 
196 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2440  hypothetical protein  41.22 
 
 
196 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1261  putative lipoprotein  41.22 
 
 
203 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1107  hypothetical protein  41.22 
 
 
222 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0861626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1102  hypothetical protein  41.22 
 
 
222 aa  94.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0899  putative lipoprotein  41.22 
 
 
223 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1566  putative lipoprotein  33.87 
 
 
222 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3031  hypothetical protein  33.87 
 
 
222 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0962  putative lipoprotein  32 
 
 
196 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3008  putative lipoprotein  32 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0475  cytochrome c class I  35.35 
 
 
133 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>