38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2304 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2304  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2440  hypothetical protein  99.49 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2395  hypothetical protein  94.39 
 
 		 196 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2399  hypothetical protein  94.39 
 
 		 196 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0224059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1783  hypothetical protein  94.39 
 
 		 196 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5721  hypothetical protein  93.37 
 
 		 200 aa  347  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0895  hypothetical protein  90.71 
 
 		 183 aa  298  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1102  hypothetical protein  82.8 
 
 		 222 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1107  hypothetical protein  82.8 
 
 		 222 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0861626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0899  putative lipoprotein  82.26 
 
 		 223 aa  275  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1261  putative lipoprotein  80.31 
 
 		 203 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3380  hypothetical protein  75.44 
 
 		 192 aa  208  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1132  hypothetical protein  78.34 
 
 		 192 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2153  hypothetical protein  77.42 
 
 		 170 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000351838 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5762  hypothetical protein  54.8 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1566  putative lipoprotein  80.16 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3031  hypothetical protein  80.16 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433788  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3844  hypothetical protein  59.75 
 
 		 164 aa  161  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4921  hypothetical protein  59.75 
 
 		 164 aa  161  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0962  putative lipoprotein  81.3 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3008  putative lipoprotein  80.83 
 
 		 176 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0894  hypothetical protein  38.64 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433345  hitchhiker  0.0055981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2441  hypothetical protein  42.75 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2305  hypothetical protein  42.75 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.720467 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2396  hypothetical protein  38.69 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1784  hypothetical protein  38.69 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2400  hypothetical protein  38.69 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  normal  0.0397764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5722  hypothetical protein  38.69 
 
 		 164 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0898  putative lipoprotein  38.93 
 
 		 168 aa  92  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1260  putative lipoprotein  36.31 
 
 		 168 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1106  putative lipoprotein  36.31 
 
 		 168 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0298305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1101  putative lipoprotein  36.31 
 
 		 168 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1131  hypothetical protein  38.81 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3381  hypothetical protein  38.81 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2154  hypothetical protein  37.37 
 
 		 184 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000384981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5763  hypothetical protein  34.29 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4922  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.874028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.538934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>