38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5762 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5762  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3844  hypothetical protein  63.06 
 
 		 164 aa  180  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4921  hypothetical protein  63.06 
 
 		 164 aa  180  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2399  hypothetical protein  58.08 
 
 		 196 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0224059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2395  hypothetical protein  58.08 
 
 		 196 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1783  hypothetical protein  58.08 
 
 		 196 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5721  hypothetical protein  56.29 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0899  putative lipoprotein  60.13 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0895  hypothetical protein  60.26 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2440  hypothetical protein  59.62 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2304  hypothetical protein  59.62 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1261  putative lipoprotein  60.13 
 
 		 203 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1107  hypothetical protein  60.13 
 
 		 222 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0861626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1102  hypothetical protein  60.13 
 
 		 222 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3380  hypothetical protein  59.64 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1132  hypothetical protein  60.51 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2153  hypothetical protein  61.94 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000351838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0894  hypothetical protein  46.03 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433345  hitchhiker  0.0055981 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2396  hypothetical protein  46.03 
 
 		 164 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2400  hypothetical protein  46.03 
 
 		 164 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  normal  0.0397764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1784  hypothetical protein  46.03 
 
 		 164 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2305  hypothetical protein  46.03 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.720467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2441  hypothetical protein  46.03 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5722  hypothetical protein  45.24 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1131  hypothetical protein  44.96 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0898  putative lipoprotein  46.03 
 
 		 168 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1260  putative lipoprotein  45.24 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1101  putative lipoprotein  45.24 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1106  putative lipoprotein  45.24 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0298305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3381  hypothetical protein  44.19 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2154  hypothetical protein  42.11 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000384981 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1566  putative lipoprotein  44.81 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3031  hypothetical protein  44.81 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0962  putative lipoprotein  44.16 
 
 		 196 aa  87.4  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3008  putative lipoprotein  57.89 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5763  hypothetical protein  34.29 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4922  hypothetical protein  32.73 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.874028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3845  hypothetical protein  32.73 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.538934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>