39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2305 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2305  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  329  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.720467 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2441  hypothetical protein  99.39 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2400  hypothetical protein  96.95 
 
 		 164 aa  296  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  normal  0.0397764 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2396  hypothetical protein  96.95 
 
 		 164 aa  296  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1784  hypothetical protein  96.95 
 
 		 164 aa  296  7e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5722  hypothetical protein  94.51 
 
 		 164 aa  290  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0894  hypothetical protein  93.9 
 
 		 164 aa  288  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433345  hitchhiker  0.0055981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1106  putative lipoprotein  85.52 
 
 		 168 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0298305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1260  putative lipoprotein  84.83 
 
 		 168 aa  227  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1101  putative lipoprotein  84.83 
 
 		 168 aa  227  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0898  putative lipoprotein  83.33 
 
 		 168 aa  221  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1131  hypothetical protein  65.45 
 
 		 189 aa  197  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3381  hypothetical protein  65.45 
 
 		 203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2154  hypothetical protein  65.29 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000384981 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5763  hypothetical protein  45.28 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3845  hypothetical protein  43.04 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.538934 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4922  hypothetical protein  43.04 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.874028 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5762  hypothetical protein  46.03 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3380  hypothetical protein  40.24 
 
 		 192 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3844  hypothetical protein  45.67 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4921  hypothetical protein  45.67 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5721  hypothetical protein  41.82 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1132  hypothetical protein  40.62 
 
 		 192 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1783  hypothetical protein  41.21 
 
 		 196 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2399  hypothetical protein  41.21 
 
 		 196 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0224059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2395  hypothetical protein  41.21 
 
 		 196 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2153  hypothetical protein  45.04 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000351838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0895  hypothetical protein  43.51 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2304  hypothetical protein  42.75 
 
 		 196 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.73763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2440  hypothetical protein  42.75 
 
 		 196 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1261  putative lipoprotein  40.62 
 
 		 203 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1107  hypothetical protein  40.62 
 
 		 222 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0861626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1102  hypothetical protein  40.62 
 
 		 222 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0899  putative lipoprotein  40 
 
 		 223 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1566  putative lipoprotein  34.65 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3031  hypothetical protein  34.65 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0962  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3008  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0475  cytochrome c class I  35.35 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>