43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0038 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  91.43 
 
 
2124 bp  1352    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  100 
 
 
1977 bp  3919    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  100 
 
 
1911 bp  3788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  99.49 
 
 
1977 bp  3840    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  98.99 
 
 
1989 bp  3798    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  100 
 
 
1977 bp  3919    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  99.8 
 
 
4602 bp  3887    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0038    100 
 
 
1977 bp  3919    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  94.55 
 
 
1827 bp  85.7  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  89.29 
 
 
1857 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  89.29 
 
 
1857 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  89.29 
 
 
1857 bp  63.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  96.88 
 
 
2826 bp  56  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0694  putative threonine-phosphate decarboxylase  96.67 
 
 
1053 bp  52  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.697335  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1631    96.67 
 
 
1026 bp  52  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1042  putative threonine-phosphate decarboxylase  96.67 
 
 
1053 bp  52  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.0057725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2968  putative threonine-phosphate decarboxylase  96.67 
 
 
1053 bp  52  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2319  putative threonine-phosphate decarboxylase  96.67 
 
 
1053 bp  52  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0907123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1197  putative threonine-phosphate decarboxylase  96.67 
 
 
1053 bp  52  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0730  hypothetical protein  91.89 
 
 
3969 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4581  hypothetical protein  100 
 
 
1503 bp  50.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0060  LPPG domain protein containing protein  96.55 
 
 
981 bp  50.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0729.1  hypothetical protein  91.89 
 
 
4578 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  85.25 
 
 
1788 bp  50.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4298  aldehyde dehydrogenase  93.94 
 
 
1458 bp  50.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.891318  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1688  hypothetical protein  91.89 
 
 
3960 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0619  hypothetical protein  91.89 
 
 
4068 bp  50.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.104026  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4168    85.25 
 
 
1786 bp  50.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  85.25 
 
 
1788 bp  50.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2138  hypothetical protein  91.89 
 
 
3987 bp  50.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2111  L-allo-threonine aldolase  100 
 
 
1059 bp  48.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5848  hypothetical protein  100 
 
 
510 bp  48.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0300  hypothetical protein  100 
 
 
492 bp  48.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.610997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3909  Holliday junction DNA helicase RuvA  96.43 
 
 
633 bp  48.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.776913  normal  0.119869 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  96.43 
 
 
942 bp  48.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 
1173 bp  48.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  100 
 
 
1173 bp  48.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0069  S-adenosyl-methyltransferase MraW  96.43 
 
 
942 bp  48.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6195  acyl-CoA dehydrogenase type 2  96.43 
 
 
1218 bp  48.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  96.43 
 
 
942 bp  48.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  96.43 
 
 
942 bp  48.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2306  MCP methyltransferase, CheR-type  93.75 
 
 
1413 bp  48.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 
1173 bp  48.1  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>