20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0106 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0106    100 
 
 		 249 bp  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.565219 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  98.78 
 
 		 1365 bp  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  80.89 
 
 		 1365 bp  105  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  96.08 
 
 		 1359 bp  85.7  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  92.45 
 
 		 1407 bp  73.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  93.02 
 
 		 1362 bp  61.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  92.86 
 
 		 1365 bp  60  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  92.86 
 
 		 1365 bp  60  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  96.88 
 
 		 1365 bp  56  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  89.58 
 
 		 1365 bp  56  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  96.88 
 
 		 1383 bp  56  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  89.58 
 
 		 1365 bp  56  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  89.36 
 
 		 1359 bp  54  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  90.7 
 
 		 1359 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  90.24 
 
 		 1368 bp  50.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  90 
 
 		 1434 bp  48.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  93.75 
 
 		 1386 bp  48.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  93.75 
 
 		 1383 bp  48.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  90 
 
 		 1368 bp  48.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 1413 bp  46.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>