169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6173 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6173  hypothetical protein  100 
 
 		 591 aa  1211    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5719  hypothetical protein  38.31 
 
 		 205 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2441  hypothetical protein  37.98 
 
 		 207 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0059  hypothetical protein  35.33 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.459485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1849  methyltransferase small  33.78 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6985  hypothetical protein  31.79 
 
 		 226 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2625  hypothetical protein  31.79 
 
 		 227 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0965  cell division protein FtsK, putative  29.86 
 
 		 941 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0893  cell division protein FtsK, putative  29.86 
 
 		 946 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1030  putative cell division protein FtsK  29.86 
 
 		 945 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.456142  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  41.1 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4192  cell division FtsK/SpoIIIE  43.55 
 
 		 930 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4346  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.55 
 
 		 931 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.389284  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4324  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.55 
 
 		 931 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2669  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.98 
 
 		 792 aa  56.2  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6273  hypothetical protein  31.03 
 
 		 226 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3749  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.28 
 
 		 1135 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.754842  normal  0.0843954 
 
 
-
 
NC_002978  WD0120  cell division protein FtsK, putative  38.71 
 
 		 704 aa  54.7  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.11 
 
 		 726 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  38.46 
 
 		 1136 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003879  cell division protein FtsK  31.85 
 
 		 1014 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000123897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1050  DNA translocase ftsk (DNA translocase SpoIIIE)  38.46 
 
 		 679 aa  53.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  36.49 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  36.49 
 
 		 786 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  38.81 
 
 		 786 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2944  DNA translocase FtsK  40 
 
 		 808 aa  52.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.18 
 
 		 1134 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0821  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE  44.83 
 
 		 924 aa  52.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0090  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.1 
 
 		 835 aa  52  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1493  putative cell division protein FtsK  31.82 
 
 		 960 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1841  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.67 
 
 		 826 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0705875  normal  0.65267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4342  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.33 
 
 		 967 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285957  normal  0.716083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01797  cell division protein FtsK  31.85 
 
 		 1120 aa  51.6  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  33.33 
 
 		 822 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  33.33 
 
 		 822 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3705  DNA translocase FtsK  41.67 
 
 		 849 aa  51.2  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  33.33 
 
 		 822 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  33.33 
 
 		 768 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  33.33 
 
 		 822 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  33.33 
 
 		 768 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  33.33 
 
 		 768 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.33 
 
 		 1091 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  33.33 
 
 		 819 aa  50.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  38.6 
 
 		 825 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0291  FtsK/SpoIIIE family protein  33.8 
 
 		 872 aa  50.8  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0133  DNA translocase  37.88 
 
 		 825 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.98 
 
 		 888 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  38.6 
 
 		 823 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1414  DNA translocase FtsK  35 
 
 		 1244 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0287873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3663  DNA translocase FtsK  40.35 
 
 		 797 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0173  FtsK/SpoIIIE family protein  40.98 
 
 		 846 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.857574  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  37.1 
 
 		 833 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0325  hypothetical protein  28.19 
 
 		 231 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000884213  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.98 
 
 		 789 aa  49.7  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1052  DNA translocase FtsK  30.36 
 
 		 1342 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000465717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3137  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.11 
 
 		 1040 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321844  normal  0.346965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  30.63 
 
 		 1342 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.63 
 
 		 1329 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0657  hypothetical protein  29.22 
 
 		 250 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  30.63 
 
 		 1329 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4120  cell divisionFtsK/SpoIIIE  38.71 
 
 		 902 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0276  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.92 
 
 		 815 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251669  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3235  DNA translocase FtsK  39.34 
 
 		 840 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  30.63 
 
 		 1369 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1342 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3052  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.68 
 
 		 890 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  30.63 
 
 		 1310 aa  48.9  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0995  DNA translocase FtsK  30.63 
 
 		 1329 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.00000000000212407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  30.63 
 
 		 1368 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000342338  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.34 
 
 		 881 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  38.46 
 
 		 1725 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.66 
 
 		 871 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  39.06 
 
 		 1784 aa  48.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1879  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.85 
 
 		 882 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4236  ftsK cell division protein  37.7 
 
 		 880 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.66 
 
 		 871 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106397  normal  0.445419 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  38.46 
 
 		 1725 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  40 
 
 		 769 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  38.46 
 
 		 1725 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  38.46 
 
 		 1725 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.66 
 
 		 872 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1723  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  31.71 
 
 		 332 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575134  hitchhiker  0.0000126689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  34.92 
 
 		 768 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1851 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4908  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.06 
 
 		 1221 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.67 
 
 		 1610 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  38.46 
 
 		 1834 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  38.46 
 
 		 1851 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0112  cell division protein FtsK, putative  37.14 
 
 		 794 aa  47.8  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.67 
 
 		 1707 aa  47.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.05 
 
 		 799 aa  47.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.67 
 
 		 1640 aa  47.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4092  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.1 
 
 		 889 aa  47.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0093  FtsK/SpoIIIE family protein  38.71 
 
 		 806 aa  47.8  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6133  ftsK cell division protein  38.33 
 
 		 954 aa  47.4  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38419  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  41.67 
 
 		 1673 aa  47.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.86 
 
 		 1157 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.67 
 
 		 1527 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  38.33 
 
 		 896 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.67 
 
 		 1527 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>