More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6133 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3768  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.68 
 
 		 895 aa  743    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.8 
 
 		 871 aa  763    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4194  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.52 
 
 		 951 aa  848    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0120  cell division protein FtsK, putative  61.98 
 
 		 704 aa  638    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3137  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.23 
 
 		 1040 aa  735    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321844  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2900  cell division FtsK/SpoIIIE  66.54 
 
 		 1091 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.694821  normal  0.686839 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0093  FtsK/SpoIIIE family protein  70.55 
 
 		 806 aa  727    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0378  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.96 
 
 		 809 aa  662    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373989  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.56 
 
 		 1094 aa  689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4120  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.11 
 
 		 902 aa  753    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1895  cell division protein FtsK, putative  72.78 
 
 		 854 aa  750    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627487  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0530  cell division protein FtsK, putative  78.3 
 
 		 821 aa  805    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4424  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66 
 
 		 781 aa  833    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.843774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1823  putative cell division protein FtsK  72.78 
 
 		 874 aa  751    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603207  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2673  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.2 
 
 		 894 aa  675    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0291  FtsK/SpoIIIE family protein  59.36 
 
 		 872 aa  806    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4908  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.52 
 
 		 1221 aa  748    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.09 
 
 		 807 aa  664    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.96 
 
 		 888 aa  759    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5497  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.9 
 
 		 845 aa  760    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.028755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1300  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.59 
 
 		 853 aa  733    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728533 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0212  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  61.51 
 
 		 848 aa  637    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  69.7 
 
 		 833 aa  714    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0282  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.18 
 
 		 822 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782905  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  66.4 
 
 		 1094 aa  688    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6133  ftsK cell division protein  100 
 
 		 954 aa  1910    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0059  DNA translocase  68.17 
 
 		 995 aa  694    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771975  hitchhiker  0.00000133062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.22 
 
 		 1134 aa  763    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.32 
 
 		 881 aa  760    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.37 
 
 		 726 aa  660    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3705  DNA translocase FtsK  64.34 
 
 		 849 aa  674    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.2 
 
 		 871 aa  766    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106397  normal  0.445419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.31 
 
 		 825 aa  712    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0428  DNA translocase FtsK  65.61 
 
 		 963 aa  684    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.7 
 
 		 872 aa  758    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0276  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.97 
 
 		 815 aa  725    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251669  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.98 
 
 		 858 aa  753    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0460  putative cell division protein FtsK  78.11 
 
 		 819 aa  805    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.83979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4092  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.08 
 
 		 889 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1841  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.77 
 
 		 826 aa  732    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0705875  normal  0.65267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.5 
 
 		 823 aa  718    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0133  DNA translocase  70.18 
 
 		 825 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0090  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.09 
 
 		 835 aa  724    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  77.36 
 
 		 830 aa  812    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0060  DNA translocase FtsK  59 
 
 		 1015 aa  689    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.513164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1816  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.25 
 
 		 852 aa  753    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1879  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.22 
 
 		 882 aa  827    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3235  DNA translocase FtsK  72.57 
 
 		 840 aa  751    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.22 
 
 		 1091 aa  764    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3052  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.51 
 
 		 890 aa  756    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4236  ftsK cell division protein  72.24 
 
 		 880 aa  745    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2944  DNA translocase FtsK  64.27 
 
 		 808 aa  675    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.59 
 
 		 1136 aa  766    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4104  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.23 
 
 		 787 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0890  putative cell division protein FtsK  60.71 
 
 		 827 aa  634  1e-180  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.452147  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.86 
 
 		 912 aa  629  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3663  DNA translocase FtsK  60.71 
 
 		 797 aa  626  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0435  DNA translocase FtsK  59.19 
 
 		 793 aa  613  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2669  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.61 
 
 		 792 aa  610  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  59.41 
 
 		 809 aa  584  1.0000000000000001e-165  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1615  DNA translocase FtsK  54.22 
 
 		 1477 aa  555  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4392  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.26 
 
 		 757 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3598  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.77 
 
 		 814 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3112  cell division protein FtsK, putative  55.58 
 
 		 745 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.711537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3475  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.26 
 
 		 780 aa  522  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.06 
 
 		 774 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0367  DNA translocase FtsK  54.13 
 
 		 760 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3970  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.06 
 
 		 774 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0647  FtsK-like cell division protein  52.23 
 
 		 751 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.212332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.63 
 
 		 776 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.1 
 
 		 799 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  50.63 
 
 		 776 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.96 
 
 		 787 aa  505  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  51.47 
 
 		 769 aa  506  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  53.36 
 
 		 777 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.27 
 
 		 716 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  51.1 
 
 		 768 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  51.1 
 
 		 768 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  51.1 
 
 		 768 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  51.1 
 
 		 822 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  51.1 
 
 		 822 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.56 
 
 		 786 aa  502  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  51.1 
 
 		 822 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.05 
 
 		 784 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  51.1 
 
 		 822 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.29 
 
 		 769 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  53.25 
 
 		 769 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  51.1 
 
 		 819 aa  499  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3426  DNA translocase FtsK  52.96 
 
 		 779 aa  497  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.643705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  49.01 
 
 		 781 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.25 
 
 		 1157 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.92 
 
 		 770 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  51.98 
 
 		 914 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  52.18 
 
 		 913 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.28 
 
 		 866 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  50.99 
 
 		 928 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.94 
 
 		 818 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1282  cell division protein  51.56 
 
 		 778 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  51.79 
 
 		 917 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.37 
 
 		 1310 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>