More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0444 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_5007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.47 
 
 
807 aa  690    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4908  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.61 
 
 
1221 aa  754    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3663  DNA translocase FtsK  49.57 
 
 
797 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0120  cell division protein FtsK, putative  62.21 
 
 
704 aa  655    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4236  ftsK cell division protein  56.29 
 
 
880 aa  861    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.38 
 
 
858 aa  851    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3052  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.28 
 
 
890 aa  858    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.26 
 
 
888 aa  882    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1895  cell division protein FtsK, putative  56.94 
 
 
854 aa  836    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627487  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0530  cell division protein FtsK, putative  69.85 
 
 
821 aa  739    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1300  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.37 
 
 
853 aa  759    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.728533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3749  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.4 
 
 
1135 aa  756    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.754842  normal  0.0843954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2673  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.46 
 
 
894 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.81 
 
 
1136 aa  761    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6133  ftsK cell division protein  69.5 
 
 
954 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38419  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1841  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.17 
 
 
826 aa  908    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0705875  normal  0.65267 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0093  FtsK/SpoIIIE family protein  52.36 
 
 
806 aa  785    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4092  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.99 
 
 
889 aa  848    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1823  putative cell division protein FtsK  57.14 
 
 
874 aa  841    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603207  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  78.27 
 
 
833 aa  1272    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4424  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.42 
 
 
781 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.843774  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5497  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.06 
 
 
845 aa  848    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.028755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.24 
 
 
1134 aa  758    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  65.7 
 
 
1094 aa  685    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2891  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.2 
 
 
1153 aa  757    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4120  cell divisionFtsK/SpoIIIE  77.13 
 
 
902 aa  759    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0059  DNA translocase  65.68 
 
 
995 aa  689    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771975  hitchhiker  0.00000133062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.02 
 
 
726 aa  666    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3705  DNA translocase FtsK  66.11 
 
 
849 aa  696    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3137  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.6 
 
 
1040 aa  720    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321844  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  92.23 
 
 
825 aa  1450    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0428  DNA translocase FtsK  67.86 
 
 
963 aa  697    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0276  cell divisionFtsK/SpoIIIE  80.92 
 
 
815 aa  1313    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251669  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0460  putative cell division protein FtsK  69.66 
 
 
819 aa  738    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.83979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.11 
 
 
871 aa  901    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4194  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.03 
 
 
951 aa  737    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445928  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
823 aa  1653    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.41 
 
 
871 aa  904    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106397  normal  0.445419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0090  cell divisionFtsK/SpoIIIE  78.2 
 
 
835 aa  1268    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0291  FtsK/SpoIIIE family protein  69.32 
 
 
872 aa  718    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0282  cell divisionFtsK/SpoIIIE  87.01 
 
 
822 aa  1368    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782905  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2900  cell division FtsK/SpoIIIE  65.96 
 
 
1091 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.694821  normal  0.686839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0060  DNA translocase FtsK  65.31 
 
 
1015 aa  693    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.513164  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3768  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.3 
 
 
895 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1879  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.49 
 
 
882 aa  741    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3235  DNA translocase FtsK  57.48 
 
 
840 aa  850    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1816  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.7 
 
 
852 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.45 
 
 
881 aa  762    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4104  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.23 
 
 
787 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0378  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.3 
 
 
809 aa  689    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2944  DNA translocase FtsK  63.6 
 
 
808 aa  687    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.74 
 
 
872 aa  898    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0133  DNA translocase  77.35 
 
 
825 aa  1214    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.48 
 
 
830 aa  758    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.43 
 
 
1091 aa  761    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.7 
 
 
1094 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2669  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.64 
 
 
792 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894947  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0212  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  57.81 
 
 
848 aa  627  1e-178  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.76 
 
 
912 aa  624  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125828  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0890  putative cell division protein FtsK  58.51 
 
 
827 aa  617  1e-175  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.452147  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0435  DNA translocase FtsK  57.58 
 
 
793 aa  597  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  57.97 
 
 
809 aa  595  1e-168  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1615  DNA translocase FtsK  52.35 
 
 
1477 aa  545  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.962365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4392  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.55 
 
 
757 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.52 
 
 
787 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.9 
 
 
799 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.07 
 
 
786 aa  515  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  52.86 
 
 
769 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  40.97 
 
 
776 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.44 
 
 
716 aa  509  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.47 
 
 
786 aa  507  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  52.73 
 
 
776 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.73 
 
 
776 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  37.81 
 
 
879 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  40.53 
 
 
801 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  55.46 
 
 
769 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.22 
 
 
733 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  0.0000950013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  39.73 
 
 
801 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0647  FtsK-like cell division protein  50.46 
 
 
751 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.212332  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.87 
 
 
789 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.42 
 
 
784 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3970  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.75 
 
 
774 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.96 
 
 
769 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.12 
 
 
1157 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3112  cell division protein FtsK, putative  52.52 
 
 
745 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.711537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3426  DNA translocase FtsK  53.05 
 
 
779 aa  497  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.643705  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  36.93 
 
 
911 aa  498  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1295  DNA translocase FtsK  49.82 
 
 
768 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.65138  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  48.84 
 
 
1369 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  52.63 
 
 
781 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.56 
 
 
774 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  52.45 
 
 
768 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.23 
 
 
866 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  52.34 
 
 
822 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  49.55 
 
 
794 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  49.73 
 
 
794 aa  494  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  52.25 
 
 
819 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  49.35 
 
 
1310 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  52.34 
 
 
822 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.89 
 
 
818 aa  495  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>