20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0059 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.459485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2441  hypothetical protein  35.48 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1849  methyltransferase small  32.63 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.105583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5719  hypothetical protein  31.95 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6173  hypothetical protein  35.33 
 
 		 591 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2810  hypothetical protein  30.33 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0573661  hitchhiker  0.0025274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6985  hypothetical protein  29.82 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4247  hypothetical protein  31.33 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4092  hypothetical protein  30.87 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1911  hypothetical protein  28.11 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2625  hypothetical protein  28.65 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6273  hypothetical protein  29.55 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0521  hypothetical protein  27.52 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01959  hypothetical protein  29.28 
 
 		 173 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  26.85 
 
 		 527 aa  51.2  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0711  hypothetical protein  32.77 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0657  hypothetical protein  26.52 
 
 		 250 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1069  putative DNA methyltransferase  31.93 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.07 
 
 		 557 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  29.41 
 
 		 451 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>