More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4236 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4104  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.55 
 
 
787 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.98 
 
 
807 aa  709    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.4 
 
 
912 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125828  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0120  cell division protein FtsK, putative  64.04 
 
 
704 aa  664    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.32 
 
 
1136 aa  748    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4236  ftsK cell division protein  100 
 
 
880 aa  1770    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.04 
 
 
1094 aa  719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2673  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.57 
 
 
894 aa  696    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1895  cell division protein FtsK, putative  65.49 
 
 
854 aa  1031    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627487  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0530  cell division protein FtsK, putative  72.83 
 
 
821 aa  738    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.9 
 
 
881 aa  772    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3052  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.32 
 
 
890 aa  1185    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0291  FtsK/SpoIIIE family protein  73.15 
 
 
872 aa  758    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.19 
 
 
1134 aa  745    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0093  FtsK/SpoIIIE family protein  75.7 
 
 
806 aa  769    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1816  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.23 
 
 
852 aa  767    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2891  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.25 
 
 
1153 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3137  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.94 
 
 
1040 aa  729    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321844  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.18 
 
 
872 aa  886    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3768  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.05 
 
 
895 aa  1201    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0212  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  59.12 
 
 
848 aa  649    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  74.45 
 
 
833 aa  751    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64 
 
 
858 aa  1036    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  70.04 
 
 
1094 aa  719    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3749  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.16 
 
 
1135 aa  756    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.754842  normal  0.0843954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4424  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.75 
 
 
781 aa  749    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.843774  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.47 
 
 
726 aa  666    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3705  DNA translocase FtsK  52.02 
 
 
849 aa  730    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0282  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.31 
 
 
822 aa  867    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.19 
 
 
1091 aa  746    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.89 
 
 
825 aa  853    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0890  putative cell division protein FtsK  60.15 
 
 
827 aa  642    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.452147  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0428  DNA translocase FtsK  69.84 
 
 
963 aa  723    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0276  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.37 
 
 
815 aa  884    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251669  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0059  DNA translocase  62.01 
 
 
995 aa  715    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771975  hitchhiker  0.00000133062 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6133  ftsK cell division protein  72.24 
 
 
954 aa  743    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.56 
 
 
871 aa  900    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.98 
 
 
823 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2900  cell division FtsK/SpoIIIE  70.44 
 
 
1091 aa  720    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.694821  normal  0.686839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0090  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.78 
 
 
835 aa  755    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.21 
 
 
888 aa  868    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1823  putative cell division protein FtsK  65.61 
 
 
874 aa  1032    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603207  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0060  DNA translocase FtsK  69.64 
 
 
1015 aa  705    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.513164  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4194  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.66 
 
 
951 aa  757    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445928  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1879  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.13 
 
 
882 aa  737    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3235  DNA translocase FtsK  65.65 
 
 
840 aa  1027    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4092  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.57 
 
 
889 aa  1203    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.72 
 
 
830 aa  751    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.56 
 
 
871 aa  899    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106397  normal  0.445419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0378  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.73 
 
 
809 aa  699    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373989  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2944  DNA translocase FtsK  73.64 
 
 
808 aa  741    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0460  putative cell division protein FtsK  72.83 
 
 
819 aa  738    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.83979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5497  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.68 
 
 
845 aa  768    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.028755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4908  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.59 
 
 
1221 aa  746    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4120  cell divisionFtsK/SpoIIIE  75.3 
 
 
902 aa  753    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3663  DNA translocase FtsK  64.13 
 
 
797 aa  629  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  60.29 
 
 
809 aa  618  1e-175  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2669  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62 
 
 
792 aa  610  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894947  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0435  DNA translocase FtsK  59.15 
 
 
793 aa  603  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1615  DNA translocase FtsK  54.48 
 
 
1477 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.962365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4392  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.58 
 
 
757 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  55.23 
 
 
769 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.51 
 
 
917 aa  532  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  0.00000000000948051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.52 
 
 
799 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  51.05 
 
 
769 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.67 
 
 
787 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  54.37 
 
 
776 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.62 
 
 
789 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.74 
 
 
818 aa  522  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0647  FtsK-like cell division protein  55.97 
 
 
751 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.212332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.73 
 
 
784 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.37 
 
 
776 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.98 
 
 
769 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0367  DNA translocase FtsK  54.46 
 
 
760 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219387  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1759  cell division FtsK/SpoIIIE  53.22 
 
 
777 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.94 
 
 
716 aa  513  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.72 
 
 
779 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.58 
 
 
770 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3112  cell division protein FtsK, putative  54.74 
 
 
745 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.711537  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  54.37 
 
 
768 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0936  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.18 
 
 
769 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470674  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  54.37 
 
 
822 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  54.37 
 
 
768 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  54.37 
 
 
822 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  54.37 
 
 
822 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3970  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.03 
 
 
774 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3426  DNA translocase FtsK  54.89 
 
 
779 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.643705  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  54.37 
 
 
768 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.31 
 
 
769 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.23 
 
 
774 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0975  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.31 
 
 
769 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  54.37 
 
 
822 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  54.95 
 
 
770 aa  508  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  50.09 
 
 
794 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0635  cell division FtsK/SpoIIIE  54.58 
 
 
755 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  53.37 
 
 
814 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.33 
 
 
1202 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  54.17 
 
 
819 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  50.37 
 
 
781 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  45.44 
 
 
837 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>