More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1723 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1723  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  100 
 
 
332 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.575134  hitchhiker  0.0000126689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  52.5 
 
 
801 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  52.5 
 
 
801 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  61.67 
 
 
802 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.66 
 
 
834 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.66 
 
 
807 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.66 
 
 
831 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.43 
 
 
896 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.93 
 
 
917 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3586  DNA translocase FtsK  60 
 
 
802 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345612  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0635  cell division FtsK/SpoIIIE  59.02 
 
 
755 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  53.33 
 
 
819 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.68 
 
 
779 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.93 
 
 
917 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  60 
 
 
973 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.93 
 
 
917 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.93 
 
 
917 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.07 
 
 
1640 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  51.85 
 
 
917 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1243  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.9 
 
 
1485 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  36.26 
 
 
911 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  59.02 
 
 
822 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  51.9 
 
 
1369 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.35 
 
 
784 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  59.02 
 
 
822 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.07 
 
 
1527 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  52.05 
 
 
1784 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  59.02 
 
 
768 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  59.02 
 
 
822 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.07 
 
 
1527 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.07 
 
 
1527 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  59.02 
 
 
768 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  59.02 
 
 
768 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  36.26 
 
 
914 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  36.26 
 
 
913 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  59.02 
 
 
822 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  52.05 
 
 
1834 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1282  cell division protein  45.98 
 
 
778 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1343  FtsK/SpoIIIE family protein  45.98 
 
 
778 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  52.05 
 
 
1725 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  52.05 
 
 
1851 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  52.05 
 
 
1725 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  59.02 
 
 
769 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  52.05 
 
 
1725 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.07 
 
 
1610 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  52.05 
 
 
1725 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  51.35 
 
 
784 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.02 
 
 
769 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  52.05 
 
 
1851 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  60.32 
 
 
928 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0847  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60 
 
 
769 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.14 
 
 
789 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0936  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60 
 
 
769 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.470674  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  52.63 
 
 
1085 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0496  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60 
 
 
769 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0975  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60 
 
 
769 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3408  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.34 
 
 
819 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3303  DNA translocase FtsK  50.63 
 
 
1430 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190344  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.38 
 
 
770 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3441  DNA translocase FtsK  57.38 
 
 
771 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1052  DNA translocase FtsK  36.59 
 
 
1342 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000465717  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.86 
 
 
818 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  48.28 
 
 
786 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  57.63 
 
 
804 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.38 
 
 
786 aa  75.9  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  48.28 
 
 
786 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  54.29 
 
 
1123 aa  75.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  57.63 
 
 
811 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  49.43 
 
 
1202 aa  75.9  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  53.62 
 
 
1673 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  36.59 
 
 
1342 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.59 
 
 
1329 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  36.59 
 
 
1368 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000342338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  36.59 
 
 
1342 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  36.59 
 
 
1310 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.62 
 
 
1707 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  36.59 
 
 
1329 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.17 
 
 
850 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0995  DNA translocase FtsK  36.59 
 
 
1329 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.00000000000212407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  36.59 
 
 
1369 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.79 
 
 
884 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  54.17 
 
 
837 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000271124  normal  0.0651093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.33 
 
 
1174 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  54.41 
 
 
879 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1002  DNA translocase FtsK  56.67 
 
 
757 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0837246  normal  0.0587694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  48.65 
 
 
814 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  57.38 
 
 
776 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.74 
 
 
763 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  47.06 
 
 
1157 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2152  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.67 
 
 
781 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.356378  normal  0.85601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1445  DNA translocase FtsK  52.86 
 
 
1107 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.64751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.17 
 
 
849 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2556  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.67 
 
 
781 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  61.67 
 
 
789 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.73 
 
 
841 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  0.00000274809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1493  putative cell division protein FtsK  48.1 
 
 
960 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121086  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1124  DNA translocase FtsK  56.67 
 
 
765 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3799  DNA translocase FtsK  53.12 
 
 
781 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.67 
 
 
932 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0690  cell division FtsK/SpoIIIE  57.38 
 
 
770 aa  72.8  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.159753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>