189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1587 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1587  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  312  9e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7587  acetyltransferase  32.89 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1721  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.473904  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0552  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1498  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
180 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000254083  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0655  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
180 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1206  GCN5-related N-acetyltransferase  35.2 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000216631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2314  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
189 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462132  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3338  acetyltransferase  28.8 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.667425  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  24.55 
 
 
170 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.263332  hitchhiker  0.00000000268657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2920  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
182 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2705  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2932  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0153421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0208114  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3471  acetyltransferase, gnat family  40.54 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.805737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0586  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
188 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.549285  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01553  spermidine N1-acetyltransferase  34.44 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2046  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01543  hypothetical protein  34.44 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 
184 aa  53.9  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2293  diamine N-acetyltransferase  34.44 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000122818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1657  diamine N-acetyltransferase  34.44 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.523929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1791  diamine N-acetyltransferase  34.44 
 
 
186 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1616  diamine N-acetyltransferase  34.44 
 
 
186 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.233984  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0363  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791622  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1778  acetyltransferase  40.54 
 
 
183 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.357267  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1672  diamine N-acetyltransferase  28.69 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.94947  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1613  diamine N-acetyltransferase  28.69 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.728332  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1604  diamine N-acetyltransferase  28.69 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1670  diamine N-acetyltransferase  28.69 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.072114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1307  GCN5-related N-acetyltransferase  36.61 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0793594  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1458  Diamine N-acetyltransferase  34.41 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.860085  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1837  diamine N-acetyltransferase  28.69 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1918  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0771647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2827  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  0.971472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
182 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3002  Diamine N-acetyltransferase  26.79 
 
 
186 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233587  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0717  acetyltransferase  31.52 
 
 
167 aa  51.2  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1232  spermidine N(1)-acetyltransferase  25 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1349  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0945  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 
179 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3118  spermidine acetyltransferase  25 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
183 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3484  acetyltransferase  37.84 
 
 
183 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.596039  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0440  spermidine N1-acetyltransferase  30.61 
 
 
178 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.321134  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001389  spermidine N1-acetyltransferase  29.32 
 
 
180 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.091207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3274  acetyltransferase  37.84 
 
 
181 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.959565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3488  acetyltransferase, gnat family  37.84 
 
 
183 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3187  acetyltransferase  37.84 
 
 
183 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.593765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2470  spermidine N1-acetyltransferase, putative  28.07 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0215406  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2859  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0355763  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09204  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14730)  37.65 
 
 
197 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1929  spermine/spermidine N-acetyltransferase  26.32 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
212 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1120  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
182 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000648101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1723  pseudaminic acid biosynthesis N-acetyl transferase  25.83 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.845429  hitchhiker  0.000000591031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6644  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
191 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3528  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
184 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3436  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5224  spermidine N1-acetyltransferase  31.91 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1556  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
168 aa  47.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0661406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3788  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
187 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1337  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669514  normal  0.138984 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4945  spermidine N1-acetyltransferase  31.91 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3250  acetyltransferase, GNAT family  31.46 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000015157  normal  0.297899 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4788  diamine N-acetyltransferase (spermidine acetyltransferase)  31.91 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1874  acetyltransferase  31.91 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.39507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4806  diamine N-acetyltransferase (spermidine acetyltransferase)  31.91 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5323  spermidine N1-acetyltransferase  31.91 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003166  ribosomal-protein-S5p-alanine acetyltransferase  28.83 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5190  spermidine N1-acetyltransferase  31.91 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2807  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0229887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2058  acetyltransferase, GNAT family  31.46 
 
 
165 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00654111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5241  diamine N-acetyltransferase  31.91 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2140  acetyltransferase  32.98 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.140339  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1125  Diamine N-acetyltransferase  27.27 
 
 
191 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.545789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2168  acetyltransferase, GNAT family  32.98 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3339  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 
197 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  40.58 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0449  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2100  acetyltransferase, GNAT family  31.91 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06378  spermidine n1-acetyltransferase  27.56 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1042  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5220  spermidine N1-acetyltransferase  30.85 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1922  acetyltransferase  31.91 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1884  acetyltransferase  31.91 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.364881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1247  GCN5-related N-acetyltransferase  27.69 
 
 
418 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.498575  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.206818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2069  acetyltransferase  31.91 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1284  MaoC-like dehydratase  26.72 
 
 
318 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3190  Diamine N-acetyltransferase  23.21 
 
 
191 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4264  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.366379 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0291  spermidine n1-acetyltransferase  31.86 
 
 
173 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>