More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1125 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1125  Diamine N-acetyltransferase  100 
 
 
191 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.545789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3190  Diamine N-acetyltransferase  97.91 
 
 
191 aa  390  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3002  Diamine N-acetyltransferase  88.52 
 
 
186 aa  337  5e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3528  GCN5-related N-acetyltransferase  84.44 
 
 
184 aa  320  9.000000000000001e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1232  spermidine N(1)-acetyltransferase  85.63 
 
 
181 aa  317  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3118  spermidine acetyltransferase  85.63 
 
 
181 aa  317  7e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1349  GCN5-related N-acetyltransferase  85.63 
 
 
181 aa  317  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01553  spermidine N1-acetyltransferase  83.24 
 
 
186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  83.24 
 
 
186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01543  hypothetical protein  83.24 
 
 
186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1791  diamine N-acetyltransferase  83.24 
 
 
186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1657  diamine N-acetyltransferase  83.24 
 
 
186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.523929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2046  GCN5-related N-acetyltransferase  83.24 
 
 
186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2293  diamine N-acetyltransferase  83.24 
 
 
186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000122818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1616  diamine N-acetyltransferase  83.24 
 
 
186 aa  311  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.233984  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1613  diamine N-acetyltransferase  82.32 
 
 
186 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.728332  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1670  diamine N-acetyltransferase  82.32 
 
 
186 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.072114  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1672  diamine N-acetyltransferase  82.32 
 
 
186 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.94947  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1604  diamine N-acetyltransferase  82.32 
 
 
186 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1837  diamine N-acetyltransferase  82.32 
 
 
186 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1929  spermine/spermidine N-acetyltransferase  85.29 
 
 
186 aa  308  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5241  diamine N-acetyltransferase  70.83 
 
 
171 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4907  GCN5-related N-acetyltransferase  71.26 
 
 
171 aa  264  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5220  spermidine N1-acetyltransferase  70.83 
 
 
176 aa  264  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5190  spermidine N1-acetyltransferase  70.24 
 
 
171 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4945  spermidine N1-acetyltransferase  70.24 
 
 
171 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4788  diamine N-acetyltransferase (spermidine acetyltransferase)  70.24 
 
 
171 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5323  spermidine N1-acetyltransferase  70.24 
 
 
171 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5224  spermidine N1-acetyltransferase  70.24 
 
 
171 aa  261  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4806  diamine N-acetyltransferase (spermidine acetyltransferase)  69.64 
 
 
171 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0022  diamine N-acetyltransferase  69.05 
 
 
171 aa  260  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.246966 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  66.08 
 
 
175 aa  242  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  62.92 
 
 
180 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.206818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4264  GCN5-related N-acetyltransferase  62.92 
 
 
180 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.366379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2859  GCN5-related N-acetyltransferase  65.87 
 
 
176 aa  236  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0355763  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  63.1 
 
 
182 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0208114  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2920  GCN5-related N-acetyltransferase  61.93 
 
 
182 aa  235  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0941  GCN5-related N-acetyltransferase  64.88 
 
 
330 aa  231  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  64.88 
 
 
330 aa  231  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0081  spermidine n(1)-acetyltransferase  62.29 
 
 
194 aa  229  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000286884  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3175  GCN5-related N-acetyltransferase  58.99 
 
 
180 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00585025  hitchhiker  0.0000100489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3149  GCN5-related N-acetyltransferase  60.11 
 
 
180 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000175005  hitchhiker  0.00000000160471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2543  GCN5-related N-acetyltransferase  58.99 
 
 
180 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00522491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  58.99 
 
 
180 aa  228  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00189616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3965  GCN5-related N-acetyltransferase  60.92 
 
 
180 aa  228  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2314  GCN5-related N-acetyltransferase  58.01 
 
 
189 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462132  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6513  GCN5-related N-acetyltransferase  57.92 
 
 
185 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00143605  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4477  putative acetyltransferase  60.92 
 
 
180 aa  227  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  unclonable  0.00000138966 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0317  spermidine n(1)-acetyltransferase  62.5 
 
 
239 aa  225  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000406096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0111  diamine N-acetyltransferase  60.69 
 
 
186 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000137834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0126  diamine N-acetyltransferase  60.69 
 
 
186 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2827  GCN5-related N-acetyltransferase  60.71 
 
 
182 aa  223  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  0.971472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2705  GCN5-related N-acetyltransferase  60.71 
 
 
182 aa  222  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  58.19 
 
 
180 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000155938  hitchhiker  0.00420903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2932  GCN5-related N-acetyltransferase  60.71 
 
 
182 aa  222  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0153421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  58.19 
 
 
180 aa  222  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111771  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06378  spermidine n1-acetyltransferase  58.24 
 
 
176 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0291  spermidine n1-acetyltransferase  56.47 
 
 
173 aa  204  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.327782  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001389  spermidine N1-acetyltransferase  56.14 
 
 
180 aa  204  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.091207  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0440  spermidine N1-acetyltransferase  58.14 
 
 
178 aa  203  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.321134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1458  Diamine N-acetyltransferase  56.02 
 
 
172 aa  201  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.860085  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1869  diamine N-acetyltransferase  57.67 
 
 
170 aa  201  8e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0323  spermidine N1-acetyltransferase  57.67 
 
 
170 aa  201  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1724  spermidine acetyltransferase  49.17 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2470  spermidine N1-acetyltransferase, putative  52.44 
 
 
165 aa  186  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0215406  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0118  spermidine N1-acetyltransferase, putative  52.12 
 
 
177 aa  184  8e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0717  acetyltransferase  50.62 
 
 
167 aa  179  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142894  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0565  acetyltransferase  49.08 
 
 
165 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00392228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2807  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
185 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0229887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000254083  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  27.78 
 
 
359 aa  88.2  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3436  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12768  acetyltransferase  30.68 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4903  acetyltransferase, gnat family  31.58 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00722603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4499  acetyltransferase  31.58 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4516  acetyltransferase  31.58 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4913  acetyltransferase  31.76 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3483  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000185806  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1206  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000216631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0655  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0263  spermidine N1-acetyltransferase, putative  27.33 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  25.6 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.263332  hitchhiker  0.00000000268657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
286 aa  68.2  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0200  acetyltransferase  40.19 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  29.65 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  29.65 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.65 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2425  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  25.57 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  29.65 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1615  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  23.6 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>