32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2295 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2295  S-layer domain protein  100 
 
 
1074 aa  2127    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1573  hypothetical protein  75.77 
 
 
1055 aa  1628    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2384  S-layer-like domain-containing protein  28.25 
 
 
189 aa  64.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  22.37 
 
 
2178 aa  57.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  25.36 
 
 
758 aa  53.9  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.6 
 
 
533 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0438  S-layer domain protein  28.15 
 
 
1157 aa  53.5  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.6 
 
 
533 aa  53.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  25.15 
 
 
1174 aa  53.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2303  S-layer domain protein  25.73 
 
 
1018 aa  52.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  25.28 
 
 
932 aa  52.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  24.18 
 
 
1847 aa  52.4  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  26.45 
 
 
2207 aa  52  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  26.67 
 
 
4630 aa  51.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  21.47 
 
 
631 aa  50.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2792  S-layer domain protein  27.03 
 
 
262 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.557365  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3325  S-layer domain protein  27.03 
 
 
262 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  24.02 
 
 
1821 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  26.78 
 
 
1208 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.66 
 
 
1016 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.7 
 
 
539 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  25.73 
 
 
880 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  23.46 
 
 
1226 aa  47  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  26.74 
 
 
282 aa  46.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  26.77 
 
 
688 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3737  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.27 
 
 
575 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3463  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.27 
 
 
575 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  26.29 
 
 
620 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  26.29 
 
 
620 aa  45.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  26.96 
 
 
1009 aa  45.8  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  27.32 
 
 
620 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  22.45 
 
 
1495 aa  44.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>