20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1298 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1298  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 292 aa  560  1.0000000000000001e-159  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0435661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 112 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 115 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 123 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 118 aa  45.8  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  37.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706879 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  37.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  37.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 103 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  31.94 
 
 		 103 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  31.94 
 
 		 103 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 112 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  27.52 
 
 		 206 aa  42.7  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>