More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0473 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0473  ATP-NAD/AcoX kinase  100 
 
 
285 aa  588  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08740  predicted sugar kinase  37.28 
 
 
286 aa  196  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.420873  unclonable  0.00000000132399 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2116  ATP-NAD/AcoX kinase  37.67 
 
 
298 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000212514  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09610  predicted sugar kinase  36.09 
 
 
301 aa  187  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.767365  normal  0.0529545 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0584  NAD(+) kinase  31.77 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0457  NAD(+) kinase  35.65 
 
 
292 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2422  NAD(+)/NADH kinase family protein  36.89 
 
 
294 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1544  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.93 
 
 
296 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.305452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3730  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.5 
 
 
296 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2012  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.5 
 
 
315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0863357  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2031  NAD kinase  32.06 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347734  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1572  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.59 
 
 
296 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0931  ATP-NAD/AcoX kinase  33.59 
 
 
309 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1542  ATP-NAD/AcoX kinase  30.77 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1035  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.21 
 
 
318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1307  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.94 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2445  ATP-NAD/AcoX kinase  36.02 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0163522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3334  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.98 
 
 
301 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1246  NAD(+) kinase  33.71 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.641624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2195  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  34.84 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1474  ATP-NAD/AcoX kinase  35.6 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0152163  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0560  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.26 
 
 
569 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2170  ATP-NAD/AcoX kinase  32.31 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00216575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1898  ATP-NAD/AcoX kinase  28.42 
 
 
286 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000307238  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2573  NAD(+) kinase  32.33 
 
 
285 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.108647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3148  ATP-NAD/AcoX kinase  32.07 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0248504  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1302  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.5 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1693  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.61 
 
 
294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1764  NAD(+) kinase  35.32 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0908  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.92 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.42987  normal  0.404915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0969  sugar kinase  33.61 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.43035  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0900  ATP-NAD/AcoX kinase  35.78 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000200756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3793  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.78 
 
 
296 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0107774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1685  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.78 
 
 
296 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2944  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  36.32 
 
 
295 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00985224  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34070  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.77 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1190  NAD(+) kinase  35.62 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04330  ATP-NAD kinase  35.84 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2650  NAD(+)/NADH kinase family protein  33.09 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1029  NAD(+) kinase  31.33 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.501907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1772  NAD(+) kinase  34.04 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148491 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1384  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.98 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0162292  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1733  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.7 
 
 
294 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2481  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.12 
 
 
312 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2409  ATP-NAD/AcoX kinase  33.08 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_400  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  37.02 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203624  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1773  NAD(+) kinase  30.66 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0435  ATP-NAD/AcoX kinase  35.71 
 
 
284 aa  126  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000978517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0731  NAD(+) kinase  31.2 
 
 
272 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2993  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.68 
 
 
292 aa  125  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000131242  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1752  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.92 
 
 
295 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.000623558 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0816  NAD(+) kinase  30.12 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1706  ATP-NAD/AcoX kinase  35.05 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1509  NAD(+) kinase  34.53 
 
 
311 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0774  NAD(+) kinase  32.88 
 
 
290 aa  125  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0611  ATP-dependent NAD kinase  34.1 
 
 
301 aa  125  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1692  ATP-NAD/AcoX kinase  29.02 
 
 
286 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.121225  hitchhiker  0.00242245 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1617  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30.97 
 
 
340 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.771585  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2887  NAD(+)/NADH kinase family protein  31.75 
 
 
312 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  32.11 
 
 
288 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2050  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.47 
 
 
295 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000972456  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1658  ATP-NAD/AcoX kinase  32.85 
 
 
290 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.059696  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1081  NAD(+) kinase  32.16 
 
 
288 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000519775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2681  ATP-NAD/AcoX kinase  31.22 
 
 
285 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24220  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.47 
 
 
295 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000172182  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2065  ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
284 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0428793  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1445  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  35.45 
 
 
299 aa  123  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00237626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  32.73 
 
 
282 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4438  ATP-NAD/AcoX kinase  30.63 
 
 
297 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0396483  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2371  ATP-NAD/AcoX kinase  30.99 
 
 
282 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5430  ATP-NAD/AcoX kinase  30.68 
 
 
301 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.399636 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0768  ATP-NAD/AcoX kinase  32.73 
 
 
282 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2327  ATP-NAD kinase  32.28 
 
 
285 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0628345  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0458  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase, putative  36.54 
 
 
284 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000633387  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1921  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  32.19 
 
 
328 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1579  NAD(+) kinase  34.93 
 
 
288 aa  122  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0775  ATP-NAD/AcoX kinase  30.8 
 
 
282 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0146172  normal  0.735032 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1651  NAD(+)/NADH kinase family protein  32.74 
 
 
298 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105713  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2888  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
293 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.4384500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1377  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  33.33 
 
 
293 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000779832  normal  0.0588551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13660  predicted sugar kinase  31.65 
 
 
314 aa  122  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1378  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30 
 
 
309 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1355  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30 
 
 
309 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000052487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1341  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30 
 
 
309 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000175505  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2827  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.86 
 
 
292 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000328242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0902  NAD(+) kinase  29.75 
 
 
269 aa  122  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00230325  normal  0.504909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2898  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.86 
 
 
292 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3006  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  30 
 
 
292 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000540691  hitchhiker  0.000000451072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2896  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.86 
 
 
292 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.72588  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1488  ATP-NAD/AcoX kinase  31.85 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2163  ATP-NAD/AcoX kinase  30.73 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0199773 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2050  NAD(+) kinase  32.47 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2471  ATP-NAD/AcoX kinase  34.06 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.462719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2509  ATP-NAD/AcoX kinase  31.06 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000348175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1525  ATP-NAD/AcoX kinase  29.01 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.367967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1523  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.15 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0941  ATP-NAD/AcoX kinase  33.33 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2878  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  31.86 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.126338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1273  inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase  29.62 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000702127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2582  ATP-NAD/AcoX kinase  32.27 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>