More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0024 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0024  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0008  tRNA-Tyr  92.86 
 
 		 82 bp  91.7  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0037  tRNA-Tyr  92.65 
 
 		 85 bp  87.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0466069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0021  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000249749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  91.04 
 
 		 82 bp  77.8  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0023  tRNA-Tyr  88.57 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0065  tRNA-Tyr  88.57 
 
 		 86 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.560905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0005  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.434844  hitchhiker  0.00676871 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0018  tRNA-Tyr  88.24 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0008  tRNA-Tyr  97.22 
 
 		 82 bp  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0021  tRNA-Tyr  95 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000055523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0065  tRNA-Tyr  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135481  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0063  tRNA-Tyr  89.66 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0528292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0060  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.500822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0044  tRNA-Tyr  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0012  tRNA-Tyr  87.93 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000201631  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0038  tRNA-Tyr  87.93 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000481051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0059  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000803667  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00025  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.413695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00026  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.593643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00075  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000048411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0049  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00226201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0050  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00114696  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0093  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000017829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0054  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t05  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000929423  unclonable  0.000000191468 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00106012  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4549  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000359327  hitchhiker  0.00000000000121072 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0021  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1568  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt04  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt04  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2336  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000102833  normal  0.0356366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1884  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1385  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0321672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0044  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1714  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0409502  normal  0.981337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4425  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181979  hitchhiker  0.0000468307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4384  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000011593  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0024  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1949  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0029  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.572111  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0021  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1947  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4474  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000330783  hitchhiker  0.00000000000000918445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0090  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000426682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0086  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000985673  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1890  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.710503  normal  0.374202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4471  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000736073  hitchhiker  0.00060065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0043  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0004  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000291052  hitchhiker  0.00000658966 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1911  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0172015  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1570  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1387  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0734169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0083  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000525158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5442  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000118281  hitchhiker  0.000431346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0065  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695286  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2800  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000115343  normal  0.0987715 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1716  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220424  normal  0.977011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1446  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0308  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.0000522223  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1886  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0997724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4663  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.25071e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0014  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000673515  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0013  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000015326  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0006  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000863158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0022  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322461  normal  0.0145309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4232  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4231  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.011802  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0017  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0316061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0108  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000394419  hitchhiker  0.00222111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0056  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133037 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0058  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0020  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.230904  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4718  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.22023e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1892  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.729122  normal  0.381192 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4352  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000588121  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0029  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4666  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000338441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4665  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00193221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5032  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306816  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0012  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000806893  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5101  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000185347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5031  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0188651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1910  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178107  normal  0.179459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4288  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0006  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000152746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0064  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.000177122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0048  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0004  tRNA-Tyr  94.44 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000458141  normal  0.383106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>