61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1788 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1788  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1043    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0316215  normal  0.102482 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1155  protein of unknown function DUF323  33.16 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0094568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
919 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.73 
 
 
916 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.45 
 
 
696 aa  53.5  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.45 
 
 
863 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
888 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.87 
 
 
551 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
894 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  23.65 
 
 
569 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  23.3 
 
 
599 aa  50.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  24 
 
 
990 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  22.93 
 
 
750 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  24.65 
 
 
455 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 
585 aa  50.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 
349 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.35 
 
 
528 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.68 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.17 
 
 
662 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3936  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.32 
 
 
746 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1433  protein kinase  22.6 
 
 
963 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698997  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0294  serine/threonine protein kinase  21.77 
 
 
757 aa  47.4  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0633635  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1549  protein kinase  22.58 
 
 
784 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0320573 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  21.38 
 
 
796 aa  47  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  25.22 
 
 
620 aa  47  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  30 
 
 
775 aa  47  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  19.31 
 
 
638 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  22.52 
 
 
982 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2824  serine/threonine protein kinase  22.78 
 
 
1020 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533566  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  19.86 
 
 
889 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1157  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.73 
 
 
1007 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  23.29 
 
 
965 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.63 
 
 
1823 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  22.67 
 
 
825 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.95 
 
 
943 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0735  serine/threonine protein kinase  23.12 
 
 
698 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  23.29 
 
 
897 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1736  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.76 
 
 
737 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  24.32 
 
 
569 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  21.25 
 
 
972 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  23.36 
 
 
776 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  25.54 
 
 
581 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.92 
 
 
728 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.45 
 
 
1076 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  21.09 
 
 
891 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  18 
 
 
761 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.45 
 
 
1072 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  23.23 
 
 
573 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  23.49 
 
 
599 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  23.47 
 
 
661 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  23.18 
 
 
509 aa  45.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  19.08 
 
 
628 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 
425 aa  44.3  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  19.86 
 
 
880 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  21.48 
 
 
586 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  26.49 
 
 
586 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.45 
 
 
1072 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  22.6 
 
 
969 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  26.49 
 
 
583 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.34 
 
 
757 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0118  putative protein kinase  19.08 
 
 
446 aa  43.5  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>