37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1140 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1140  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  724    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.263074 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0731  hypothetical protein  62.79 
 
 
346 aa  461  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.123054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2076  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
324 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249499  normal  0.0477078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1456  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
371 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.68 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1192  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
386 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
421 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
382 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
382 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
382 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
373 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
768 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3626  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
393 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
365 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 
385 aa  46.2  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
411 aa  46.2  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
373 aa  46.2  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3220  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
364 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1997  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.723795  normal  0.0390531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4101  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
393 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496207  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2850  hypothetical protein  24.62 
 
 
311 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 
753 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3331  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0844  putative glycosyltransferase  29.51 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0684167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0333  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
339 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.279236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0721  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 
534 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.920452  normal  0.491923 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
354 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5893  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
519 aa  42.7  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.440344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>