16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3928 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3928    100 
 
 		 522 bp  1035    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4972    83.12 
 
 		 339 bp  99.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0092    100 
 
 		 219 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1905  hypothetical protein  100 
 
 		 306 bp  61.9  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.519601  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  94.74 
 
 		 1083 bp  60  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  94.74 
 
 		 1083 bp  60  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  96.77 
 
 		 411 bp  54  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  96.77 
 
 		 411 bp  54  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  96.77 
 
 		 411 bp  54  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  91.89 
 
 		 833 bp  50.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  91.89 
 
 		 833 bp  50.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2897    91.89 
 
 		 832 bp  50.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484077  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3093  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 606 bp  48.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0252517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4973    90 
 
 		 452 bp  48.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.188883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2459  hypothetical protein  100 
 
 		 3861 bp  46.1  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.505985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0171  hypothetical protein  93.55 
 
 		 1140 bp  46.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.8382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>