27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0092 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0092    100 
 
 
219 bp  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1905  hypothetical protein  97.64 
 
 
306 bp  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.519601  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  92.59 
 
 
411 bp  301  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  92.59 
 
 
411 bp  301  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  92.59 
 
 
411 bp  301  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  83.82 
 
 
426 bp  143  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  83.82 
 
 
426 bp  143  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  83.82 
 
 
426 bp  143  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  83.82 
 
 
426 bp  143  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  83.82 
 
 
426 bp  143  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  83.82 
 
 
426 bp  143  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  83.82 
 
 
426 bp  143  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  83.82 
 
 
426 bp  143  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1733  putative TIS1421-transposase orfA protein  83.97 
 
 
195 bp  93.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  82.47 
 
 
426 bp  91.7  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  83.67 
 
 
405 bp  67.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3928    100 
 
 
522 bp  61.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  82.65 
 
 
405 bp  60  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  82.65 
 
 
405 bp  60  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  82.65 
 
 
405 bp  60  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  82.65 
 
 
405 bp  60  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  82.65 
 
 
405 bp  60  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  89.58 
 
 
806 bp  56  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  89.58 
 
 
806 bp  56  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2278  hypothetical protein  92.31 
 
 
528 bp  54  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  96.67 
 
 
806 bp  52  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  96.67 
 
 
806 bp  52  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>