16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2897 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  99.52 
 
 
833 bp  1612    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  99.52 
 
 
833 bp  1612    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  86.1 
 
 
824 bp  698    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  86.62 
 
 
833 bp  753    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2897    100 
 
 
832 bp  1649    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1205    89.44 
 
 
366 bp  412  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1284    83.13 
 
 
324 bp  186  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.272591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2623  hypothetical protein  82.96 
 
 
549 bp  167  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1187    83.41 
 
 
518 bp  141  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2894    86.49 
 
 
114 bp  101  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.09152  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  82.3 
 
 
806 bp  65.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  82.3 
 
 
806 bp  65.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3528    90.48 
 
 
462 bp  52  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3928    91.89 
 
 
522 bp  50.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  96.43 
 
 
1446 bp  48.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  93.75 
 
 
806 bp  48.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>