More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3718 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3718  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
330 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  52.42 
 
 
322 aa  348  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0485  Mg2 transporter protein CorA family protein  54.52 
 
 
322 aa  342  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  48.96 
 
 
330 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0913  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  49.85 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0926548  decreased coverage  0.00569345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0906  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  49.55 
 
 
331 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0923  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  49.55 
 
 
331 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1217  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  46.43 
 
 
330 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732452  normal  0.131023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0297  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.34 
 
 
354 aa  262  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5126  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  47.01 
 
 
330 aa  261  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.913238  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0970  Mg2 transporter protein CorA family protein  46.2 
 
 
342 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.609858  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1754  Mg2 transporter protein CorA family protein  41.42 
 
 
324 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.72 
 
 
321 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.23 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.31 
 
 
322 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.94 
 
 
339 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3668  Mg2 transporter protein CorA family protein  47.83 
 
 
304 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5013  magnesium/cobalt transporter CorA  30.25 
 
 
325 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117877  normal  0.108957 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.9 
 
 
325 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.9 
 
 
325 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.9 
 
 
325 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.98 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.98 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1643  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.98 
 
 
325 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222374  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1642  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.3 
 
 
325 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.83 
 
 
323 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.98 
 
 
325 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.83 
 
 
323 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.56 
 
 
325 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5093  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.21 
 
 
347 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  hitchhiker  0.0090718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2311  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.57 
 
 
325 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  27.83 
 
 
326 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0198  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.23 
 
 
357 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  31.82 
 
 
366 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1910  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.15 
 
 
334 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5376  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.21 
 
 
347 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.904617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0816  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.48 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  27.74 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1539  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.34 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.555793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.74 
 
 
365 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  29.76 
 
 
363 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1843  Mg2+/Co2+ transporter  31.41 
 
 
323 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1421  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.41 
 
 
323 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.29 
 
 
322 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  31.48 
 
 
360 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3867  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  31.41 
 
 
323 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.17 
 
 
322 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.19 
 
 
325 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.06 
 
 
353 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.06 
 
 
353 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.06 
 
 
353 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.97 
 
 
322 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1452  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.28 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.786219  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.4 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.72 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7673  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.87 
 
 
334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.690652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5404  Mg2 transporter protein CorA family protein  30.93 
 
 
326 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0808766 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  25.86 
 
 
363 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  28.62 
 
 
372 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.22 
 
 
323 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0287  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.34 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523176  normal  0.774272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.49 
 
 
341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  27.94 
 
 
325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2064  magnesium and cobalt transport protein, putative  32.89 
 
 
323 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00816438  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.14 
 
 
323 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.76 
 
 
316 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.1 
 
 
291 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0126  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.57 
 
 
322 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000115284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1874  Mg2+ transporter protein, CorA-like  32.89 
 
 
323 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.3 
 
 
325 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4482  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.52 
 
 
374 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436374  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.81 
 
 
375 aa  136  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0881  putative metal ion transporter  30.35 
 
 
345 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1239  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.24 
 
 
325 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1675  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.58 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2181  Mg2 transporter protein CorA family protein  32.2 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0833206  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.38 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2270  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.89 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0371321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4178  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.08 
 
 
322 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0171  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.48 
 
 
365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215108  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  29.55 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1864  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.23 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.22 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1912  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.33 
 
 
374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.64 
 
 
324 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1248  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.96 
 
 
321 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0484421  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  26.83 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0098  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  28.25 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194887  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.35 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2855  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.76 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1399  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.56 
 
 
354 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1742  Mg2+ transporter protein, CorA-like  29.21 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.63 
 
 
325 aa  129  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.96 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2140  magnesium/cobalt transporter CorA  28 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.84 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00453  magnesium and cobalt transport protein  30.25 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.98 
 
 
354 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.43 
 
 
354 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2504  putative metal ion transport protein  27.71 
 
 
321 aa  126  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>