268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3668 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3668  Mg2 transporter protein CorA family protein  100 
 
 
304 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3718  Mg2 transporter protein CorA family protein  47.83 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0414  Mg2 transporter protein CorA family protein  43.18 
 
 
322 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0984247  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0297  Mg2 transporter protein CorA family protein  49.14 
 
 
354 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0053  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  44.5 
 
 
330 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0614291  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0906  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  48.6 
 
 
331 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0923  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  48.6 
 
 
331 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0913  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  48.6 
 
 
331 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0926548  decreased coverage  0.00569345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0485  Mg2 transporter protein CorA family protein  44 
 
 
322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1217  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  41.94 
 
 
330 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732452  normal  0.131023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5126  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  51.25 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.913238  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0970  Mg2 transporter protein CorA family protein  50 
 
 
342 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.609858  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1754  Mg2 transporter protein CorA family protein  44.59 
 
 
324 aa  116  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1091  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.13 
 
 
322 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0036  Mg2+ transporter protein, CorA-like protein  37.67 
 
 
360 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5733  magnesium and cobalt transport protein CorA  38 
 
 
321 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.57 
 
 
355 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0560  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.47 
 
 
321 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.78 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.29 
 
 
351 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.22 
 
 
354 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0065  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.54 
 
 
323 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  32 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2421  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.33 
 
 
322 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  36.05 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1732  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.41 
 
 
355 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.61 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.54 
 
 
353 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  29.53 
 
 
363 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.54 
 
 
353 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.03 
 
 
354 aa  93.2  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06540  Mg2+/Co2+ transporter  33.33 
 
 
363 aa  93.2  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4989  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.26 
 
 
376 aa  92.8  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2098  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.85 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0642  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.459619  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  36 
 
 
327 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0126  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.56 
 
 
322 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000115284  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0899  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.14 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2085  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.89 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0674  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.72 
 
 
404 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4550  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.97 
 
 
323 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1999  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.403451  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2224  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.2 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000656607  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3478  Mg2 transporter protein CorA family protein  31.97 
 
 
323 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1813  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 
367 aa  89  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.406453  normal  0.0884578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3587  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.55 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  28.85 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01784  magnesium/cobalt transporter CorA  31.97 
 
 
323 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0057  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.67 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0739  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.97 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000829129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0841  Mg2+ transporter protein, CorA-like  38.51 
 
 
324 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  29.53 
 
 
358 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.46 
 
 
381 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.26 
 
 
339 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1482  Mg2 transporter protein CorA family protein  35.33 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0136304  normal  0.215972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4421  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.45 
 
 
324 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377619  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2213  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.65 
 
 
365 aa  87  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3070  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.69 
 
 
339 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11264  magnesium and cobalt transport transmembrane protein corA  35.33 
 
 
366 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00777117  hitchhiker  0.000740018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0795  magnesium/cobalt transporter CorA  28.76 
 
 
380 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.52 
 
 
352 aa  86.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.53 
 
 
367 aa  85.9  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3541  Mg2+ transporter protein, CorA-like  33.11 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.28913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2221  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.89 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.79 
 
 
375 aa  85.9  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0204  Mg2 transporter protein CorA family protein  37.74 
 
 
391 aa  85.5  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174805  hitchhiker  0.00515093 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_521  magnesium and cobalt transport protein  26.35 
 
 
354 aa  85.5  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.015404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6428  magnesium/cobalt transporter CorA  33.94 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00820748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.37 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2163  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.7 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0100402  hitchhiker  0.00146942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.76 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.2 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0271  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.44 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.2 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1996  magnesium/cobalt transporter CorA  31.61 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215662  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.08 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1953  magnesium and cobalt transport protein  34 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1735  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.68 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1621  Mg2 transporter protein CorA family protein  28.77 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.688884  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0881  putative metal ion transporter  38 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.61 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2266  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.68 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1888  Mg2 transporter protein CorA family protein  33.33 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.1107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2077  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.68 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2133  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.68 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.52 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0979  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.68 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272451  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3978  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.97 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1248  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.52 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0484421  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4052  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.97 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3992  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.97 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106328  normal  0.19247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3987  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.33 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.67 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1248  magnesium and cobalt transport protein CorA  34.48 
 
 
380 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.713487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0387  putative metal ion transporter  33.56 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2264  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.97 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6358  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.03 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1721  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.03 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0582  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.35 
 
 
354 aa  82.4  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000747796  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.52 
 
 
354 aa  82.4  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>