184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3231 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3231  potassium-transporting ATPase subunit A  100 
 
 
540 aa  1075    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1440  potassium-transporting ATPase A subunit  57.32 
 
 
553 aa  631  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4092  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.7 
 
 
604 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27060  K+-transporting ATPase, KdpA  57.5 
 
 
556 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.465729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0433  Potassium-transporting ATPase  55.98 
 
 
553 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.963684  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3287  potassium-transporting ATPase subunit A  55.43 
 
 
553 aa  568  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3782  potassium-transporting ATPase, A subunit  56.75 
 
 
558 aa  561  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6791  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.21 
 
 
561 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.324857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4759  potassium-transporting ATPase subunit A  53.5 
 
 
556 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169502  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0600  potassium-transporting ATPase subunit A  54.23 
 
 
569 aa  555  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4226  potassium-transporting ATPase subunit A  54.95 
 
 
556 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307212  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4292  potassium-transporting ATPase subunit A  54.95 
 
 
556 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.966467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4604  potassium-transporting ATPase subunit A  55.14 
 
 
556 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1016  potassium-transporting ATPase, A subunit  57.63 
 
 
557 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0388223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1510  potassium-transporting ATPase, A subunit  58.02 
 
 
556 aa  538  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000595781  hitchhiker  0.00707045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5034  potassium-transporting ATPase subunit A  57.99 
 
 
551 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3382  potassium-transporting ATPase subunit A  47.53 
 
 
590 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5835  potassium-transporting ATPase subunit A  50.89 
 
 
567 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.069816  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1704  potassium-transporting ATPase subunit A  54.39 
 
 
546 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.215119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11047  potassium-transporting ATPase subunit A  50.09 
 
 
571 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6747  potassium-transporting ATPase subunit A  50.18 
 
 
567 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194122  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3244  potassium-transporting ATPase, A subunit  56.36 
 
 
552 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3413  potassium-transporting ATPase subunit A  49.28 
 
 
567 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0209  potassium-transporting ATPase subunit A  50 
 
 
571 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202017  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3240  potassium-transporting ATPase subunit A  50.18 
 
 
571 aa  502  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.47874  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2275  potassium-transporting ATPase subunit A  48.25 
 
 
579 aa  503  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0177  potassium-transporting ATPase subunit A  51.08 
 
 
571 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133184  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4550  potassium-transporting ATPase subunit A  49.64 
 
 
567 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3267  potassium-transporting ATPase subunit A  46.77 
 
 
590 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.749431  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3589  potassium-transporting ATPase subunit A  46.77 
 
 
590 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122147  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1871  potassium-transporting ATPase, A subunit  49.48 
 
 
582 aa  495  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3230  potassium-transporting ATPase subunit A  49.54 
 
 
574 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1875  potassium-transporting ATPase subunit A  52.9 
 
 
555 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.928804  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3776  potassium-transporting ATPase subunit A  48.3 
 
 
567 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0193  potassium-transporting ATPase subunit A  49.91 
 
 
571 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.699521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0954  potassium-transporting ATPase subunit A  49.37 
 
 
571 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0662  potassium-transporting ATPase subunit A  48.66 
 
 
567 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0038  potassium-transporting ATPase subunit A  48.7 
 
 
610 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2826  potassium-transporting ATPase, A subunit  47.76 
 
 
569 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6338  potassium-transporting ATPase subunit A  47.49 
 
 
567 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5358  potassium-transporting ATPase subunit A  50.54 
 
 
569 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267227  normal  0.0726113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2293  potassium-transporting ATPase subunit A  47.66 
 
 
605 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4645  potassium-transporting ATPase subunit A  49.37 
 
 
567 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2994  potassium-transporting ATPase subunit A  47.67 
 
 
567 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4995  potassium-transporting ATPase subunit A  48.37 
 
 
575 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2217  potassium-transporting ATPase subunit A  47.88 
 
 
595 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.631048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1227  potassium-transporting ATPase subunit A  47.26 
 
 
592 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6074  potassium-transporting ATPase subunit A  47.24 
 
 
569 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00655  potassium-transporting ATPase subunit A  48.01 
 
 
557 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2938  potassium-transporting ATPase, A subunit  48.01 
 
 
557 aa  474  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1087  potassium-transporting ATPase subunit A  46.21 
 
 
592 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.43397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00646  hypothetical protein  48.01 
 
 
557 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0720  potassium-transporting ATPase subunit A  47.83 
 
 
557 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.621163  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0551  potassium-transporting ATPase subunit A  47.65 
 
 
557 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2958  potassium-transporting ATPase subunit A  48.01 
 
 
557 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.982785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0745  potassium-transporting ATPase subunit A  48.01 
 
 
557 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0724  potassium-transporting ATPase subunit A  47.83 
 
 
557 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2433  potassium-transporting ATPase subunit A  46.61 
 
 
586 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000446057  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0791  potassium-transporting ATPase subunit A  47.83 
 
 
557 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0233  potassium-transporting ATPase subunit A  50.63 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2480  potassium-transporting ATPase subunit A  47.68 
 
 
592 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1178  potassium-transporting ATPase, A subunit  49.19 
 
 
564 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0874  potassium-transporting ATPase, A subunit  48.17 
 
 
572 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.481077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1155  potassium-transporting ATPase subunit A  48.11 
 
 
569 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1159  potassium-transporting ATPase subunit A  46.32 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1670  potassium-transporting ATPase subunit A  43.73 
 
 
596 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.646576  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2091  potassium-transporting ATPase, A subunit  48.3 
 
 
572 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1108  potassium-transporting ATPase subunit A  46.32 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0722  potassium-transporting ATPase, A subunit  49.04 
 
 
576 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2507  K+ transporting ATPase A chain  47.61 
 
 
576 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0510  potassium-transporting ATPase subunit A  46.47 
 
 
591 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328065  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2488  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.36 
 
 
564 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.597919  normal  0.127393 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3582  potassium-transporting ATPase subunit A  46.14 
 
 
562 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  45.18 
 
 
578 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110111  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1468  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.27 
 
 
567 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.084132  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2242  potassium-transporting ATPase, A subunit  49.52 
 
 
564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00752993  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0814  potassium-transporting ATPase subunit A  46.38 
 
 
559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0754  potassium-transporting ATPase subunit A  46.38 
 
 
559 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.380625  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1265  potassium-transporting ATPase subunit A  50.86 
 
 
551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1676  potassium-transporting ATPase subunit A  45.85 
 
 
601 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2608  potassium-transporting ATPase subunit A  45.32 
 
 
594 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2326  potassium-transporting ATPase subunit A  45.78 
 
 
601 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497145  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2288  potassium-transporting ATPase subunit A  45.85 
 
 
601 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1130  potassium-transporting ATPase subunit A  46.21 
 
 
561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  46.74 
 
 
559 aa  448  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.515707  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3488  potassium-transporting ATPase, A subunit  48.39 
 
 
565 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.515132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2311  potassium-transporting ATPase subunit A  45.85 
 
 
601 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2204  potassium-transporting ATPase subunit A  45.85 
 
 
601 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.891481 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0864  potassium-transporting ATPase subunit A  46.38 
 
 
559 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2047  potassium-transporting ATPase subunit A  49.52 
 
 
564 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.931973  normal  0.439277 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0828  potassium-transporting ATPase subunit A  46.38 
 
 
559 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2923  potassium-transporting ATPase subunit A  50.67 
 
 
551 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.519235  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0767  potassium-transporting ATPase subunit A  46.46 
 
 
559 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5615  potassium-transporting ATPase subunit A  45.18 
 
 
601 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43400  potassium-transporting ATPase subunit A  48.3 
 
 
564 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24054  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1479  potassium-transporting ATPase, A subunit  47.4 
 
 
568 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3604  potassium-transporting ATPase subunit A  45.2 
 
 
599 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.894614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1218  potassium-transporting ATPase subunit A  47.11 
 
 
562 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.924812  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0990  potassium-transporting ATPase subunit A  45.69 
 
 
601 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1021  potassium-transporting ATPase subunit A  46.02 
 
 
602 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>