184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2488 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3230  potassium-transporting ATPase subunit A  59.17 
 
 
574 aa  643    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2433  potassium-transporting ATPase subunit A  60.11 
 
 
586 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000446057  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2488  potassium-transporting ATPase, A subunit  100 
 
 
564 aa  1100    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.597919  normal  0.127393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1227  potassium-transporting ATPase subunit A  60.65 
 
 
592 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2480  potassium-transporting ATPase subunit A  57.73 
 
 
592 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2608  potassium-transporting ATPase subunit A  56.41 
 
 
594 aa  618  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0717  potassium-transporting ATPase, A subunit  55.32 
 
 
576 aa  584  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000927315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2275  potassium-transporting ATPase subunit A  52.19 
 
 
579 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3582  potassium-transporting ATPase subunit A  54.53 
 
 
562 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1159  potassium-transporting ATPase subunit A  54.53 
 
 
562 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2091  potassium-transporting ATPase, A subunit  56.05 
 
 
572 aa  547  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3382  potassium-transporting ATPase subunit A  51.38 
 
 
590 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4995  potassium-transporting ATPase subunit A  54.17 
 
 
575 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1108  potassium-transporting ATPase subunit A  54.35 
 
 
562 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1479  potassium-transporting ATPase, A subunit  56.4 
 
 
568 aa  541  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0954  potassium-transporting ATPase subunit A  54.07 
 
 
571 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2217  potassium-transporting ATPase subunit A  52.64 
 
 
595 aa  537  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.631048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1130  potassium-transporting ATPase subunit A  53.53 
 
 
561 aa  536  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227065  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0662  potassium-transporting ATPase subunit A  52.14 
 
 
567 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3267  potassium-transporting ATPase subunit A  50.77 
 
 
590 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.749431  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1871  potassium-transporting ATPase, A subunit  51.66 
 
 
582 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1248  potassium-transporting ATPase subunit A  54.71 
 
 
562 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353689  normal  0.87869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2293  potassium-transporting ATPase subunit A  51.56 
 
 
605 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3589  potassium-transporting ATPase subunit A  50.52 
 
 
590 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122147  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  50.09 
 
 
578 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110111  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1218  potassium-transporting ATPase subunit A  54.79 
 
 
562 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.924812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5615  potassium-transporting ATPase subunit A  51.78 
 
 
601 aa  528  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0038  potassium-transporting ATPase subunit A  51.27 
 
 
610 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1676  potassium-transporting ATPase subunit A  51.1 
 
 
601 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2326  potassium-transporting ATPase subunit A  51.44 
 
 
601 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497145  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2288  potassium-transporting ATPase subunit A  51.1 
 
 
601 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2311  potassium-transporting ATPase subunit A  51.1 
 
 
601 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6338  potassium-transporting ATPase subunit A  50.71 
 
 
567 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1087  potassium-transporting ATPase subunit A  51.11 
 
 
592 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.43397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1155  potassium-transporting ATPase subunit A  51.79 
 
 
569 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4550  potassium-transporting ATPase subunit A  50.98 
 
 
567 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2507  K+ transporting ATPase A chain  51.77 
 
 
576 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0209  potassium-transporting ATPase subunit A  51.18 
 
 
571 aa  524  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202017  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0990  potassium-transporting ATPase subunit A  51.19 
 
 
601 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0177  potassium-transporting ATPase subunit A  53.54 
 
 
571 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133184  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6747  potassium-transporting ATPase subunit A  51.62 
 
 
567 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194122  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2826  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.06 
 
 
569 aa  521  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2927  potassium-transporting ATPase subunit A  54.2 
 
 
561 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0193  potassium-transporting ATPase subunit A  53.54 
 
 
571 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.699521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2204  potassium-transporting ATPase subunit A  50.59 
 
 
601 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.891481 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2938  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.63 
 
 
557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0754  potassium-transporting ATPase subunit A  53.44 
 
 
559 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.380625  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0767  potassium-transporting ATPase subunit A  53.55 
 
 
559 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2994  potassium-transporting ATPase subunit A  51.26 
 
 
567 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0510  potassium-transporting ATPase subunit A  51.38 
 
 
591 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328065  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0814  potassium-transporting ATPase subunit A  53.44 
 
 
559 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5835  potassium-transporting ATPase subunit A  51.44 
 
 
567 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.069816  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0355  potassium-transporting ATPase subunit A  50.42 
 
 
601 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0864  potassium-transporting ATPase subunit A  53.44 
 
 
559 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1670  potassium-transporting ATPase subunit A  49.57 
 
 
596 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.646576  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0828  potassium-transporting ATPase subunit A  53.44 
 
 
559 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068706 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0724  potassium-transporting ATPase subunit A  52.36 
 
 
557 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00655  potassium-transporting ATPase subunit A  52.63 
 
 
557 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2242  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.58 
 
 
564 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00752993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0791  potassium-transporting ATPase subunit A  51.91 
 
 
557 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3413  potassium-transporting ATPase subunit A  50.99 
 
 
567 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2958  potassium-transporting ATPase subunit A  52.63 
 
 
557 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.982785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4645  potassium-transporting ATPase subunit A  51.26 
 
 
567 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00646  hypothetical protein  52.63 
 
 
557 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1440  potassium-transporting ATPase A subunit  51.01 
 
 
553 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  51.39 
 
 
559 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.515707  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0551  potassium-transporting ATPase subunit A  52.09 
 
 
557 aa  515  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0720  potassium-transporting ATPase subunit A  51.91 
 
 
557 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.621163  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0745  potassium-transporting ATPase subunit A  52.63 
 
 
557 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1021  potassium-transporting ATPase subunit A  51.27 
 
 
602 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69964  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6074  potassium-transporting ATPase subunit A  51.61 
 
 
569 aa  511  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3604  potassium-transporting ATPase subunit A  50 
 
 
599 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.894614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  48.62 
 
 
811 aa  508  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2047  potassium-transporting ATPase subunit A  51.85 
 
 
564 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.931973  normal  0.439277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3240  potassium-transporting ATPase subunit A  51.61 
 
 
571 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.47874  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3776  potassium-transporting ATPase subunit A  50.89 
 
 
567 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1393  potassium-transporting ATPase subunit A  51.1 
 
 
602 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1241  potassium-transporting ATPase subunit A  51.1 
 
 
602 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.863816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1249  potassium-transporting ATPase subunit A  51.1 
 
 
602 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3231  potassium-transporting ATPase subunit A  51.04 
 
 
540 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2057  potassium-transporting ATPase subunit A  51.78 
 
 
601 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0612031  normal  0.429028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27060  K+-transporting ATPase, KdpA  53.16 
 
 
556 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.465729 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1876  potassium-transporting ATPase subunit A  51.1 
 
 
602 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1083  potassium-transporting ATPase subunit A  51.1 
 
 
602 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0784  potassium-transporting ATPase subunit A  51.1 
 
 
602 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0366  potassium-transporting ATPase subunit A  51.1 
 
 
602 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0874  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.3 
 
 
572 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.481077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43400  potassium-transporting ATPase subunit A  52.27 
 
 
564 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24054  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1677  potassium-transporting ATPase subunit A  50.62 
 
 
583 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0233  potassium-transporting ATPase subunit A  52.81 
 
 
571 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4759  potassium-transporting ATPase subunit A  50 
 
 
556 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169502  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3640  potassium-transporting ATPase subunit A  51.91 
 
 
564 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4161  potassium-transporting ATPase subunit A  52.03 
 
 
564 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.222505  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0433  Potassium-transporting ATPase  52 
 
 
553 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.963684  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1308  potassium-transporting ATPase subunit A  50.59 
 
 
601 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.157336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0600  potassium-transporting ATPase subunit A  50.27 
 
 
569 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3733  potassium-transporting ATPase subunit A  53.65 
 
 
564 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3782  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.17 
 
 
558 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11047  potassium-transporting ATPase subunit A  47.86 
 
 
571 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0443  potassium-transporting ATPase, A subunit  48.26 
 
 
584 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>