20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1167 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1167  plasmid stabilization system  100 
 
 
87 aa  168  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0847  plasmid stabilization system  43.75 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1940  plasmid stabilization system  43.94 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24250  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.77 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278684  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12882  hypothetical protein  41.03 
 
 
87 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0735  hypothetical protein  33.75 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1978  hypothetical protein  33.75 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3416  addiction module antitoxin  39.44 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866915  normal  0.0981554 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1777  cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  46.51 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2333  plasmid stabilization system protein  38.75 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282685  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1039  addiction module antitoxin  29.49 
 
 
85 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.584776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2679  plasmid stabilization system protein  47.62 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0131274  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2458  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000245877  unclonable  0.000000000270671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3231  hypothetical protein  30.38 
 
 
88 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.73498  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1966  addiction module toxin, RelE/StbE  41.67 
 
 
85 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0245113  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0193  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  31.25 
 
 
88 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3192  plasmid stabilization system  39.22 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0600  hypothetical protein  42.86 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0628  addiction module toxin, RelE/StbE family  32 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1442  hypothetical protein  41.86 
 
 
59 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0362351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>