84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3261 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3261  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  202  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.510303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2772  hypothetical protein  48.19 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  66.67 
 
 
116 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  65.31 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  65.31 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  62.26 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  66.67 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  66.67 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  66.67 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  66.67 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  63.27 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  58 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  58 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
336 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  54 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  54 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  54 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3697  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  54 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  54 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  54 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
190 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
190 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  54 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  56 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  56 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  43.75 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  43.75 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  57.78 
 
 
201 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  50 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  50 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  50 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0940  hypothetical protein  37.33 
 
 
254 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.2166  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0174  IS4 family transposase  51.06 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  51.06 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  48.94 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  51.06 
 
 
186 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  51.06 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  51.06 
 
 
186 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2296  transposase  51.06 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2282  hypothetical protein  43.1 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4122  hypothetical protein  48.94 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1839  transposase, IS4 family protein  48.94 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181674  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  54.55 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  54.55 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  44.07 
 
 
251 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  44.07 
 
 
251 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1439  hypothetical protein  42.55 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  62.5 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  48.08 
 
 
260 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  44.68 
 
 
210 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  29.27 
 
 
252 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  44.68 
 
 
210 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  44.68 
 
 
210 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0317  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384563  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  42.86 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2822  transposase, IS4  44.68 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  46.15 
 
 
252 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  46.15 
 
 
252 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>