5155 genes were found for organism Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Xaut_0001  CDS  NC_009720  330  1850  +  1521  chromosomal replication initiation protein  YP_001414917  normal  0.0129481  hitchhiker  0.0000000143408  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0002  CDS  NC_009720  2273  3394  +  1122  DNA polymerase III subunit beta  YP_001414918  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0003  CDS  NC_009720  3580  4716  +  1137  recombination protein F  YP_001414919  normal  0.322535  hitchhiker  0.000000874576  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0004  CDS  NC_009720  4865  6118  +  1254  extracellular ligand-binding receptor  YP_001414920  normal  1  hitchhiker  0.00000538672  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0005  CDS  NC_009720  6258  7142  +  885  inner-membrane translocator  YP_001414921  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0006  CDS  NC_009720  7160  8194  +  1035  inner-membrane translocator  YP_001414922  normal  0.273042  hitchhiker  0.0000215345  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0007  CDS  NC_009720  8191  8928  +  738  ABC transporter related  YP_001414923  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0008  CDS  NC_009720  8909  9685  +  777  ABC transporter related  YP_001414924  normal  0.419449  hitchhiker  0.000235622  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0009  CDS  NC_009720  9715  10419  +  705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001414925  normal  0.865732  hitchhiker  0.000720123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0010  CDS  NC_009720  10609  11328  -  720  GntR family transcriptional regulator  YP_001414926  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0011  CDS  NC_009720  11359  12504  -  1146  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001414927  normal  0.556568  normal  0.0107863  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0012  CDS  NC_009720  12683  13225  +  543  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001414928  normal  1  normal  0.0867027  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0013  CDS  NC_009720  13215  14123  -  909  acetylglutamate kinase  YP_001414929  normal  1  normal  0.0962097  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0014  CDS  NC_009720  14398  16035  +  1638  hypothetical protein  YP_001414930  normal  1  normal  0.111993  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0015  CDS  NC_009720  16132  17265  +  1134  amidohydrolase 3  YP_001414931  normal  1  normal  0.0974182  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0016  CDS  NC_009720  17279  18343  -  1065  hypothetical protein  YP_001414932  normal  1  normal  0.142957  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0017  CDS  NC_009720  18608  19246  +  639  ChaC family protein  YP_001414933  normal  1  normal  0.189731  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0018  CDS  NC_009720  19385  19786  -  402  hypothetical protein  YP_001414934  normal  0.83286  normal  0.512902  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0019  CDS  NC_009720  19820  20641  -  822  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_001414935  normal  0.917675  normal  0.550209  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0020  CDS  NC_009720  20779  21681  -  903  hypothetical protein  YP_001414936  normal  0.275341  normal  0.580582  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0021  CDS  NC_009720  21683  22684  -  1002  hypothetical protein  YP_001414937  normal  0.873886  normal  0.792877  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0022  CDS  NC_009720  22671  23378  -  708  cell division ATP-binding protein FtsE  YP_001414938  normal  0.640793  normal  0.772345  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0023  CDS  NC_009720  23612  24148  +  537  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  YP_001414939  normal  1  normal  0.732847  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0024  CDS  NC_009720  24215  24853  -  639  hypothetical protein  YP_001414940  normal  1  normal  0.767481  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0025  CDS  NC_009720  24850  25722  -  873  ABC-2 type transporter  YP_001414941  normal  1  normal  0.792877  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0026  CDS  NC_009720  25733  26530  -  798  ABC transporter related  YP_001414942  normal  1  normal  0.757841  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0027  CDS  NC_009720  26788  27774  -  987  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  YP_001414943  normal  1  normal  0.804553  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0028  CDS  NC_009720  27828  29090  -  1263  hypothetical protein  YP_001414944  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0029  CDS  NC_009720  29268  29843  +  576  hypothetical protein  YP_001414945  normal  0.85026  normal  0.998134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0030  CDS  NC_009720  29922  30458  +  537  hypothetical protein  YP_001414946  normal  0.639548  normal  0.937966  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0031  CDS  NC_009720  30458  31444  +  987  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  YP_001414947  normal  0.870241  normal  0.96246  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0032  CDS  NC_009720  31646  32155  -  510  formaldehyde-activating protein  YP_001414948  normal  1  normal  0.848098  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0033  CDS  NC_009720  32664  32939  +  276  hypothetical protein  YP_001414949  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0034  CDS  NC_009720  33093  34046  +  954  heat shock protein HtpX  YP_001414950  normal  1  normal  0.900094  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0035  CDS  NC_009720  34202  36967  +  2766  DNA mismatch repair protein MutS  YP_001414951  normal  1  normal  0.892203  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0036  CDS  NC_009720  37170  38552  -  1383  hypothetical protein  YP_001414952  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0037  CDS  NC_009720  38706  40052  -  1347  adenylosuccinate synthetase  YP_001414953  normal  0.505248  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0038  CDS  NC_009720  40184  41599  +  1416  sun protein  YP_001414954  normal  0.27971  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0039  CDS  NC_009720  41667  43511  +  1845  heparinase II/III family protein  YP_001414955  normal  0.644544  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0040  CDS  NC_009720  43520  44203  -  684  GntR family transcriptional regulator  YP_001414956  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0041  CDS  NC_009720  44236  44922  -  687  putative alcohol dehydrogenase class III  YP_001414957  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0042  CDS  NC_009720  45014  46186  -  1173  extracellular ligand-binding receptor  YP_001414958  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0043  CDS  NC_009720  46275  46997  -  723  ABC transporter related  YP_001414959  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0044  CDS  NC_009720  46999  47760  -  762  ABC transporter related  YP_001414960  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0045  CDS  NC_009720  47757  48599  -  843  inner-membrane translocator  YP_001414961  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0046  CDS  NC_009720  48599  49471  -  873  inner-membrane translocator  YP_001414962  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0047  CDS  NC_009720  49805  51631  +  1827  ATPase central domain-containing protein  YP_001414963  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0048  CDS  NC_009720  51711  52601  -  891  DNA binding domain-containing protein  YP_001414964  normal  1  normal  0.774788  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0049  CDS  NC_009720  52721  53443  +  723  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  YP_001414965  normal  1  normal  0.520432  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0050  CDS  NC_009720  53475  54428  -  954  cation diffusion facilitator family transporter  YP_001414966  normal  1  normal  0.374526  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0051  CDS  NC_009720  54663  55421  -  759  hypothetical protein  YP_001414967  normal  1  normal  0.514774  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0052  CDS  NC_009720  55577  56425  -  849  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  YP_001414968  normal  1  normal  0.257261  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0053  CDS  NC_009720  56652  57875  -  1224  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  YP_001414969  normal  1  normal  0.387678  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0054  CDS  NC_009720  57930  58487  -  558  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  YP_001414970  normal  1  normal  0.232719  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0055  CDS  NC_009720  58831  59253  +  423  large conductance mechanosensitive channel protein  YP_001414971  normal  1  normal  0.153997  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0056  CDS  NC_009720  59274  60347  -  1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  YP_001414972  normal  1  normal  0.183663  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0057  CDS  NC_009720  60356  61054  -  699  orotate phosphoribosyltransferase  YP_001414973  normal  1  normal  0.242194  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0058  CDS  NC_009720  61785  65297  -  3513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  YP_001414974  normal  0.950876  normal  0.562732  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0059  CDS  NC_009720  65598  66410  +  813  hypothetical protein  YP_001414975  normal  0.382992  normal  0.326534  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0060  CDS  NC_009720  66525  67205  -  681  phospholipase/carboxylesterase  YP_001414976  normal  0.885579  normal  0.31865  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0061  CDS  NC_009720  67298  67813  -  516  MarR family transcriptional regulator  YP_001414977  normal  1  normal  0.310818  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0062  CDS  NC_009720  67965  68393  +  429  OsmC family protein  YP_001414978  normal  1  normal  0.60601  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0063  CDS  NC_009720  68632  69234  +  603  hypothetical protein  YP_001414979  normal  0.507662  normal  0.868207  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0064  CDS  NC_009720  69302  70864  -  1563  RNA polymerase, sigma 54 subunit, RpoN  YP_001414980  normal  0.353758  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0065  CDS  NC_009720  70926  71858  -  933  ABC transporter related  YP_001414981  normal  0.127578  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0066  CDS  NC_009720  72102  72794  -  693  OstA family protein  YP_001414982  normal  0.297106  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0067  CDS  NC_009720  72791  73711  -  921  hypothetical protein  YP_001414983  normal  0.690329  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0068  CDS  NC_009720  73947  74567  -  621  3'-5' exonuclease  YP_001414984  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0069  CDS  NC_009720  74724  75209  +  486  cyanovirin containing protein  YP_001414985  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0070  CDS  NC_009720  75294  77147  -  1854  dihydroxy-acid dehydratase  YP_001414986  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0071  CDS  NC_009720  77388  78812  +  1425  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  YP_001414987  normal  0.621553  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0072  CDS  NC_009720  78818  79360  -  543  hypothetical protein  YP_001414988  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0073  CDS  NC_009720  79363  79755  -  393  chromosomal replication initiator DnaA domain-containing protein  YP_001414989  normal  0.716218  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0074  CDS  NC_009720  79981  80247  +  267  hypothetical protein  YP_001414990  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0075  CDS  NC_009720  80313  81299  -  987  cysteine synthase A  YP_001414991  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0076  CDS  NC_009720  81349  81789  -  441  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001414992  normal  0.285137  normal  0.795882  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0077  CDS  NC_009720  81800  82276  -  477  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  YP_001414993  normal  0.144209  normal  0.576359  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0078  CDS  NC_009720  82273  83490  -  1218  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase  YP_001414994  normal  0.314451  normal  0.694305  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0079  CDS  NC_009720  83713  84921  +  1209  putative diguanylate cyclase  YP_001414995  normal  1  normal  0.672881  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0080  CDS  NC_009720  84976  86331  +  1356  transposase IS4 family protein  YP_001414996  normal  0.627325  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0081  CDS  NC_009720  86322  87755  +  1434  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_001414997  normal  0.868403  normal  0.67958  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0082  CDS  NC_009720  88123  89916  +  1794  transcriptional regulator NifA  YP_001414998  normal  1  normal  0.765061  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0083  CDS  NC_009720  90310  90504  +  195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001414999  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0084  CDS  NC_009720  90834  92318  +  1485  FeS assembly protein SufB  YP_001415000  normal  1  normal  0.597876  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0085  CDS  NC_009720  92375  93136  +  762  FeS assembly ATPase SufC  YP_001415001  normal  1  normal  0.503804  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0086  CDS  NC_009720  93141  94481  +  1341  FeS assembly protein SufD  YP_001415002  normal  0.902249  normal  0.567441  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0087  CDS  NC_009720  94482  95744  +  1263  SufS subfamily cysteine desulfurase  YP_001415003  normal  0.595541  normal  0.828259  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0088  CDS  NC_009720  96387  97298  +  912  nitrogenase reductase  YP_001415004  normal  0.55556  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0089  CDS  NC_009720  97375  98880  +  1506  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  YP_001415005  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0090  CDS  NC_009720  98968  100527  +  1560  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  YP_001415006  normal  1  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0091  CDS  NC_009720  100648  102549  +  1902  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  YP_001415007  normal  0.77225  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0092  CDS  NC_009720  102559  103986  +  1428  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  YP_001415008  normal  0.14452  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0093  CDS  NC_009720  104011  104406  +  396  nitrogen fixation protein NifX  YP_001415009  normal  0.071454  normal  0.884171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0094  CDS  NC_009720  104415  104885  +  471  hypothetical protein  YP_001415010  normal  0.123891  normal  0.916048  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0095  CDS  NC_009720  104901  105101  +  201  hypothetical protein  YP_001415011  normal  0.253511  normal  0.848098  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0096  CDS  NC_009720  105120  105416  +  297  ferredoxin III 4(4Fe-4S) nif-specific  YP_001415012  normal  0.418618  normal  0.870899  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0097  CDS  NC_009720  105560  106228  +  669  NifQ family protein  YP_001415013  normal  0.428951  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0098  CDS  NC_009720  106468  106785  -  318  hypothetical protein  YP_001415014  normal  0.243247  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0099  CDS  NC_009720  106791  107042  -  252  hypothetical protein  YP_001415015  normal  0.22253  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Xaut_0100  CDS  NC_009720  107055  107915  -  861  rhodanese domain-containing protein  YP_001415016  normal  0.602678  normal  1  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 52    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>