55 genes were found for organism Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
ECH74115_A0001  CDS  NC_011351  93  1103  +  1011  plasmid replication protein  YP_002268511  normal  1  normal  0.773057  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0002  CDS  NC_011351  1226  1495  +  270  hypothetical protein  YP_002268512  normal  1  normal  0.812648  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0003  CDS  NC_011351  1624  1785  +  162  hypothetical protein  YP_002268513  normal  1  normal  0.801834  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0004  CDS  NC_011351  1757  2029  +  273  hypothetical protein  YP_002268514  normal  1  normal  0.83274  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0005  CDS  NC_011351  2203  2439  +  237  hypothetical protein  YP_002268515  normal  1  normal  0.815817  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0006  CDS  NC_011351  2450  3451  +  1002  conjugal transfer protein  YP_002268516  normal  1  normal  0.623118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0007  CDS  NC_011351  3453  3677  +  225  hypothetical protein  YP_002268517  normal  1  normal  0.667299  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0008  CDS  NC_011351  3677  4318  +  642  conjugal transfer protein TrbJ  YP_002268518  normal  0.873266  normal  0.733423  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0009  CDS  NC_011351  4386  4997  +  612  conjugal transfer protein  YP_002268519  normal  0.461383  normal  0.692739  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0010  CDS  NC_011351  4990  5283  +  294  conjugal transfer prepropilin  YP_002268520  normal  1  normal  0.996204  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0011  CDS  NC_011351  5311  5661  +  351  conjugal transfer protein TraD  YP_002268521  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0012  CDS  NC_011351  5658  8036  +  2379  conjugal transfer protein  YP_002268522  normal  1  normal  0.829213  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0013  CDS  NC_011351  8167  8904  +  738  conjugal transfer protein TraG  YP_002268523  normal  1  normal  0.734906  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0014  CDS  NC_011351  8901  9680  +  780  conjugal transfer outer membrane protein TraH  YP_002268524  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0015  CDS  NC_011351  9670  10812  +  1143  conjugal transfer protein TraI  YP_002268525  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0016  CDS  NC_011351  10812  11831  +  1020  P-type DNA transfer ATPase VirB11  YP_002268526  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0017  CDS  NC_011351  11883  13850  +  1968  conjugal transfer protein TraK  YP_002268527  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0018  CDS  NC_011351  13866  14171  +  306  TrbM-domain protein  YP_002268528  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0019  CDS  NC_011351  14272  15894  +  1623  repeated sequence found in lipoprotein LPP  YP_002268529  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0020  CDS  NC_011351  15924  16151  +  228  hypothetical protein  YP_002268530  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0021  CDS  NC_011351  16276  16863  +  588  hypothetical protein  YP_002268531  normal  1  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0022  CDS  NC_011351  16875  19031  +  2157  DNA topoisomerase III  YP_002268532  normal  0.270283  normal  0.995092  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0023  CDS  NC_011351  19194  19379  +  186  hypothetical protein  YP_002268533  normal  0.775103  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0024  CDS  NC_011351  19711  20007  +  297  hypothetical protein  YP_002268534  normal  0.873979  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0025    NC_011351  20879  21682  +  804      normal  0.131581  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0026  CDS  NC_011351  21718  21933  +  216  putative integral membrane protein  YP_002268535  hitchhiker  0.0093551  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0027  CDS  NC_011351  22258  22398  -  141  hypothetical protein  YP_002268537  hitchhiker  0.000680914  normal  0.660734  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0028  CDS  NC_011351  21940  22278  +  339  hypothetical protein  YP_002268536  hitchhiker  0.000861406  normal  0.55393  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0029  CDS  NC_011351  22878  22991  -  114  hypothetical protein  YP_002268538  hitchhiker  0.000253423  normal  0.976078  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0030  CDS  NC_011351  22958  23140  -  183  hypothetical protein  YP_002268539  hitchhiker  0.000317968  normal  0.996204  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0031  CDS  NC_011351  23185  24000  +  816  resolvase  YP_002268540  decreased coverage  0.000452405  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0032  CDS  NC_011351  24116  24775  +  660  putative plasmid partition protein A  YP_002268541  normal  0.0137071  normal  0.591473  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0033  CDS  NC_011351  24807  25436  +  630  hypothetical protein  YP_002268542  normal  0.0131893  normal  0.90746  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0034  CDS  NC_011351  25480  25782  +  303  hypothetical protein  YP_002268543  normal  0.0154075  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0035  CDS  NC_011351  25818  26102  +  285  hypothetical protein  YP_002268544  normal  0.0282537  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0036  CDS  NC_011351  26112  26411  +  300  hypothetical protein  YP_002268545  normal  0.0285351  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0037  CDS  NC_011351  26460  29657  -  3198  relaxase  YP_002268546  normal  0.204416  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0038  CDS  NC_011351  29654  29989  -  336  relaxosome component  YP_002268547  normal  0.176135  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0039  CDS  NC_011351  30335  30742  +  408  hypothetical protein  YP_002268548  hitchhiker  0.00319488  normal  0.875806  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0040  CDS  NC_011351  30752  31513  +  762  TraL  YP_002268549  normal  0.0136277  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0041  CDS  NC_011351  31510  32214  +  705  hypothetical protein  YP_002268550  normal  0.0246552  normal  0.762123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0042  CDS  NC_011351  32243  32680  -  438  hypothetical protein  YP_002268551  normal  0.567863  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0043  CDS  NC_011351  32705  32887  -  183  hypothetical protein  YP_002268552  normal  0.475275  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0044  CDS  NC_011351  33110  33244  -  135  hypothetical protein  YP_002268553  normal  0.443201  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0045  CDS  NC_011351  33318  33596  -  279  CcgD protein  YP_002268554  normal  0.51622  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0046  CDS  NC_011351  33654  33983  -  330  hypothetical protein  YP_002268555  normal  0.496837  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0047  CDS  NC_011351  34129  34275  +  147  hypothetical protein  YP_002268556  normal  0.415359  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0048  CDS  NC_011351  34421  34678  -  258  YajA protein  YP_002268557  normal  0.452855  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0049  CDS  NC_011351  34653  34919  -  267  hypothetical protein  YP_002268558  normal  0.607972  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0050  CDS  NC_011351  34970  35266  -  297  hypothetical protein  YP_002268559  normal  0.459435  normal  1  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0051  CDS  NC_011351  35290  35514  -  225  hypothetical protein  YP_002268560  normal  0.324748  normal  0.993782  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0052  CDS  NC_011351  35555  35878  -  324  hypothetical protein  YP_002268561  normal  0.268999  normal  0.97429  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0053  CDS  NC_011351  36025  36171  +  147  hypothetical protein  YP_002268562  normal  0.444939  normal  0.95682  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0054  CDS  NC_011351  36673  37026  +  354  hypothetical protein  YP_002268563  normal  1  normal  0.806108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
ECH74115_A0055  CDS  NC_011351  37252  37443  +  192  hypothetical protein  YP_002268564  normal  0.956249  normal  0.801834  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>