88 genes were found for organism Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Sbal223_4329  CDS  NC_011664  254  874  621  hypothetical protein  YP_002360218  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4330  CDS  NC_011664  967  1239  273  hypothetical protein  YP_002360219  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4331  CDS  NC_011664  1566  1808  243  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  YP_002360220  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4332  CDS  NC_011664  1798  2082  285  addiction module toxin, RelE/StbE family  YP_002360221  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4333  CDS  NC_011664  2281  3204  924  transposase IS4 family protein  YP_002360222  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4334  CDS  NC_011664  3408  4436  1029  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_002360223  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4335    NC_011664  4660  5837  1178      normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4336    NC_011664  5920  6935  1016      normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4337    NC_011664  7004  7234  231      normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4338  CDS  NC_011664  7508  8380  873  Integrase catalytic region  YP_002360224  normal  0.97265  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4339  CDS  NC_011664  8517  10472  1956  hypothetical protein  YP_002360225  normal  0.0720745  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4340    NC_011664  10614  11173  560      hitchhiker  0.0000345949  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4341  CDS  NC_011664  11326  12018  693  Transposase and inactivated derivatives-like protein  YP_002360226  hitchhiker  0.0000000209545  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4342  CDS  NC_011664  12180  13043  864  hypothetical protein  YP_002360227  decreased coverage  0.000000000000497642  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4343  CDS  NC_011664  13277  13885  609  Resolvase domain protein  YP_002360228  hitchhiker  0.000112202  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4344  CDS  NC_011664  13952  14251  300  hypothetical protein  YP_002360229  hitchhiker  0.0020221  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4345  CDS  NC_011664  14468  15160  693  Transposase and inactivated derivatives-like protein  YP_002360230  normal  0.177177  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4346  CDS  NC_011664  15444  15611  168  hypothetical protein  YP_002360231  normal  0.248266  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4347  CDS  NC_011664  15638  15784  147  hypothetical protein  YP_002360232  normal  0.178437  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4348  CDS  NC_011664  15910  16269  360  hypothetical protein  YP_002360233  normal  0.197084  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4349  CDS  NC_011664  16262  16948  687  ParA protein, putative  YP_002360234  normal  0.108838  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4350    NC_011664  17335  17504  170      normal  0.0111338  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4351  CDS  NC_011664  18333  20990  2658  hypothetical protein  YP_002360235  decreased coverage  0.0000110268  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4352  CDS  NC_011664  21272  21832  561  Resolvase domain protein  YP_002360236  hitchhiker  0.00813261  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4353  CDS  NC_011664  21836  24868  3033  transposase Tn3 family protein  YP_002360237  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4354    NC_011664  24902  25078  177      normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4355  CDS  NC_011664  25321  25923  603  Resolvase domain protein  YP_002360238  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4356  CDS  NC_011664  26272  26979  708  hypothetical protein  YP_002360239  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4357  CDS  NC_011664  27003  27632  630  hypothetical protein  YP_002360240  normal  normal  0.980149  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4358  CDS  NC_011664  28212  28886  675  hypothetical protein  YP_002360241  normal  normal  0.707207  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4359  CDS  NC_011664  29061  29834  774  hypothetical protein  YP_002360242  normal  normal  0.878642  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4360  CDS  NC_011664  30450  31013  564  hypothetical protein  YP_002360243  normal  0.5207  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4361  CDS  NC_011664  31091  31801  711  hypothetical protein  YP_002360244  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4362  CDS  NC_011664  32053  32889  837  hypothetical protein  YP_002360245  normal  0.384224  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4363  CDS  NC_011664  33028  33261  234  hypothetical protein  YP_002360246  normal  0.194969  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4364  CDS  NC_011664  33406  33780  375  putative phage associated protein  YP_002360247  normal  0.205807  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4365  CDS  NC_011664  34230  35327  1098  ParB family protein  YP_002360248  normal  0.0572236  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4366  CDS  NC_011664  35327  36526  1200  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002360249  decreased coverage  0.00100758  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4367  CDS  NC_011664  36695  36922  228  hypothetical protein  YP_002360250  hitchhiker  0.00015686  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4368  CDS  NC_011664  37583  38314  732  hypothetical protein  YP_002360251  hitchhiker  0.00696144  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4369  CDS  NC_011664  38761  38862  102  hypothetical protein  YP_002360252  hitchhiker  0.00705451  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4370  CDS  NC_011664  39063  39320  258  hypothetical protein  YP_002360253  hitchhiker  0.00862207  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4371  CDS  NC_011664  39422  39610  189  hypothetical protein  YP_002360254  normal  0.0371213  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4372  CDS  NC_011664  39674  40048  375  hypothetical protein  YP_002360255  normal  0.0879392  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4373  CDS  NC_011664  40052  40354  303  type IV conjugative transfer system protein TraL  YP_002360256  normal  0.142155  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4374  CDS  NC_011664  40395  40961  567  type IV conjugative transfer system protein TraE  YP_002360257  normal  0.23647  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4375  CDS  NC_011664  40961  41779  819  type-F conjugative transfer system secretin TraK  YP_002360258  normal  0.879332  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4376  CDS  NC_011664  41776  43302  1527  TraB pilus assembly family protein  YP_002360259  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4377  CDS  NC_011664  43323  43778  456  type IV conjugative transfer system protein TraV  YP_002360260  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4378  CDS  NC_011664  43782  46370  2589  type-IV secretion system protein TraC  YP_002360261  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4379  CDS  NC_011664  46372  46743  372  conjugal transfer protein TrbI  YP_002360262  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4380  CDS  NC_011664  46740  47444  705  type-F conjugative transfer system protein TraW  YP_002360263  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4381  CDS  NC_011664  47431  48444  1014  TraU family protein  YP_002360264  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4382  CDS  NC_011664  48467  49207  741  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  YP_002360265  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4383  CDS  NC_011664  49204  51006  1803  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  YP_002360266  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4384  CDS  NC_011664  51003  51878  876  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  YP_002360267  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4385  CDS  NC_011664  51892  52329  438  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  YP_002360268  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4386  CDS  NC_011664  52341  52505  165  hypothetical protein  YP_002360269  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4387  CDS  NC_011664  52502  53890  1389  TraH family protein  YP_002360270  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4388  CDS  NC_011664  53893  56706  2814  TraG domain protein  YP_002360271  normal  normal  0.812374  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4389  CDS  NC_011664  56744  57277  534  hypothetical protein  YP_002360272  normal  normal  0.695472  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4390  CDS  NC_011664  57280  59406  2127  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  YP_002360273  normal  normal  0.734886  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4391  CDS  NC_011664  59420  59599  180  hypothetical protein  YP_002360274  normal  normal  0.909824  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4392  CDS  NC_011664  59658  65618  5961  conjugative transfer relaxase protein TraI  YP_002360275  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4393  CDS  NC_011664  65639  65998  360  hypothetical protein  YP_002360276  normal  normal  0.736055  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4394  CDS  NC_011664  67489  68313  825  hypothetical protein  YP_002360277  hitchhiker  0.00000000168334  normal  0.0128027  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4395    NC_011664  68723  71845  3123      hitchhiker  0.00345264  decreased coverage  0.00443856  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4396  CDS  NC_011664  69045  70154  1110  transposase IS4 family protein  YP_002360278  hitchhiker  0.000348998  normal  0.0139807  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4397  CDS  NC_011664  71845  72816  972  protein of unknown function DUF1603  YP_002360279  normal  0.0853571  decreased coverage  0.00644229  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4398  CDS  NC_011664  73022  74377  1356  integrase family protein  YP_002360280  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4399  CDS  NC_011664  74374  75504  1131  integrase family protein  YP_002360281  normal  0.685705  normal  0.0426652  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4400  CDS  NC_011664  75859  76158  300  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  YP_002360282  normal  0.523025  normal  0.092938  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4401  CDS  NC_011664  76207  77205  999  domain of unknown function DUF1738  YP_002360283  normal  0.505635  normal  0.161946  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4402  CDS  NC_011664  77780  78007  228  HicB-related protein  YP_002360284  normal  normal  0.380526  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4403  CDS  NC_011664  78120  78629  510  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002360285  normal  normal  0.527623  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4404  CDS  NC_011664  78610  78903  294  Protein of unknown function DUF1778  YP_002360286  normal  normal  0.590781  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4405  CDS  NC_011664  79273  79674  402  hypothetical protein  YP_002360287  normal  normal  0.618674  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4406  CDS  NC_011664  79676  80299  624  hypothetical protein  YP_002360288  normal  normal  0.637894  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4407  CDS  NC_011664  80975  81196  222  hypothetical protein  YP_002360289  normal  normal  0.715799  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4408  CDS  NC_011664  81227  81715  489  hypothetical protein  YP_002360290  normal  normal  0.920567  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4409  CDS  NC_011664  81717  82172  456  hypothetical protein  YP_002360291  normal  normal  0.901332  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4410  CDS  NC_011664  82297  84177  1881  ParB domain protein nuclease  YP_002360292  normal  normal  0.902867  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4411  CDS  NC_011664  84568  84801  234  hypothetical protein  YP_002360293  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4412    NC_011664  84816  85007  192      normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4413  CDS  NC_011664  85017  86176  1160  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002360294  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4414    NC_011664  86246  86458  213      normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4415  CDS  NC_011664  86871  87050  180  hypothetical protein  YP_002360295  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4416  CDS  NC_011664  87009  87926  918  hypothetical protein  YP_002360296  normal  normal  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>