12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4375 on replicon NC_011664
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4538  type-F conjugative transfer system secretin TraK  100 
 
 		 272 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30335  normal  0.434856 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4375  type-F conjugative transfer system secretin TraK  100 
 
 		 272 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.879332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4445  Type-F conjugative transfer system secretin TraK  99.63 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4441  type-F conjugative transfer system secretin TraK  99.63 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4630  type-F conjugative transfer system secretin TraK  98.9 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4499  type-F conjugative transfer system secretin TraK  98.9 
 
 		 271 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_05  conjugative transfer protein TraK  41.42 
 
 		 251 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0025  hypothetical protein  24.53 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0036  conjugal transfer protein TraK  24.01 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0017  hypothetical protein  32.29 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.379631  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4286  conjugal transfer protein TraK  22.99 
 
 		 246 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4182  hypothetical protein  23.24 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000230688  hitchhiker  0.0000485707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>