24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Leu-2 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0572  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  73.8  0.000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0433  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 83 bp  61.9  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0019  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.65356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0029  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 84 bp  60  0.00000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0582952  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0050  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 83 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.840462  normal  0.934802 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R29  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0019  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0031  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0696891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0031  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 84 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0067  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 83 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0028  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0070  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.39882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0002  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.180392  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0001  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2160  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000000935406  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0001  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133172  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0046  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.339805  hitchhiker  0.00120057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0037  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0032  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.447803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>