More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2218 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2218  chorismate binding-like protein  100 
 
 
661 aa  1371    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2109  chorismate-binding domain-containing protein  95.95 
 
 
664 aa  1316    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.546386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2508  chorismate-binding domain-containing protein  97.22 
 
 
534 aa  1081    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000325173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  29.21 
 
 
994 aa  233  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 
973 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2676  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 
991 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3962  Chorismate binding-like protein  26.77 
 
 
463 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000441604  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4330  salicylate synthase  37.05 
 
 
444 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0369  Chorismate binding-like protein  26.19 
 
 
441 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  36.15 
 
 
1678 aa  163  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0621  salicylate synthase  33.33 
 
 
455 aa  158  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12411  salicylate synthase MbtI  33.21 
 
 
450 aa  134  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  26.32 
 
 
507 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1043  anthranilate synthase  24.34 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000237624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5704  anthranilate synthase component I  25.87 
 
 
513 aa  73.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3220  anthranilate synthase component I  23.95 
 
 
498 aa  73.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  23.17 
 
 
494 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1255  anthranilate synthase component I  22.97 
 
 
500 aa  72.8  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1554  anthranilate synthase component I  23.08 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0288667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28130  anthranilate synthase component I  25.1 
 
 
517 aa  71.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0715  hypothetical protein  24.92 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0153032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1271  anthranilate synthase, component I  24.51 
 
 
485 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  24.9 
 
 
485 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1546  hypothetical protein  23.53 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.128316  normal  0.0451663 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2603  anthranilate synthase  28.35 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0445726  normal  0.0808647 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1071  anthranilate synthase, component I  22.37 
 
 
485 aa  68.9  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.14675  normal  0.387124 
 
 
-
 
NC_002936  DET1481  anthranilate synthase component I  24.12 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1291  anthranilate synthase component I  24 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3579  anthranilate synthase component I  24.62 
 
 
574 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736027  normal  0.0487715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  22.1 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1144  anthranilate synthase component I  24.7 
 
 
472 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000269912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  23.49 
 
 
489 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4583  para-aminobenzoate synthase, subunit I  22.36 
 
 
732 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1832  hypothetical protein  24 
 
 
435 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.973309  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1256  Anthranilate synthase  23.86 
 
 
443 aa  66.6  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1592  Anthranilate synthase  24.6 
 
 
484 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0852867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  24.44 
 
 
474 aa  65.1  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1496  anthranilate synthase component I  23.3 
 
 
516 aa  64.3  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  21.28 
 
 
496 aa  64.7  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  22.22 
 
 
475 aa  64.3  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2239  anthranilate synthase  23.21 
 
 
434 aa  63.9  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  22.81 
 
 
465 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4375  Anthranilate synthase  23.32 
 
 
477 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  22.09 
 
 
514 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  22.09 
 
 
517 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1992  anthranilate synthase component I  22.22 
 
 
525 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.221966  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  22.56 
 
 
495 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  24.4 
 
 
412 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5714  anthranilate synthase component I  23.27 
 
 
516 aa  61.6  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4053  anthranilate synthase component I  24 
 
 
472 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000211788  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2812  Anthranilate synthase  22.05 
 
 
470 aa  61.2  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  24.9 
 
 
476 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2494  anthranilate synthase component I  22.68 
 
 
492 aa  60.8  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.184686  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1356  anthranilate synthase component I  24.4 
 
 
470 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00259909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3020  anthranilate synthase component I  21.56 
 
 
525 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  23.83 
 
 
451 aa  60.1  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10930  anthranilate synthase, component I  22.22 
 
 
516 aa  60.1  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.108361  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1766  para-aminobenzoate synthase, subunit I  21.84 
 
 
718 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0071  anthranilate synthase  22.53 
 
 
417 aa  60.1  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46640  anthranilate synthase component I  21.29 
 
 
492 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1541  anthranilate synthase component I  21.8 
 
 
478 aa  59.7  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0228  anthranilate synthase  22.31 
 
 
515 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  24.24 
 
 
449 aa  59.7  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1366  para-aminobenzoate synthase, subunit I  20.62 
 
 
762 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0518359 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5806  para-aminobenzoate synthase, subunit I  20.78 
 
 
732 aa  58.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00431194  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2480  para-aminobenzoate synthase component I  23.05 
 
 
512 aa  58.2  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07940  anthranilate synthase component I  21.62 
 
 
492 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127058 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1248  anthranilate synthase component I  24 
 
 
471 aa  57.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000139959  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1316  anthranilate synthase component I  24 
 
 
472 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17681  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  22.52 
 
 
506 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1769  anthranilate synthase component I  21.19 
 
 
539 aa  57.8  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.498968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  22.5 
 
 
428 aa  57.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1928  anthranilate synthase component I  21.8 
 
 
525 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.929386 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1156  anthranilate synthase component I  24 
 
 
475 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.306407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2950  anthranilate synthase component I  22.68 
 
 
525 aa  57.4  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4201  para-aminobenzoate synthase component I  22.22 
 
 
462 aa  57.4  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0880526  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1283  anthranilate synthase component I  21.05 
 
 
548 aa  57.4  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1746  Anthranilate synthase  22.61 
 
 
520 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0156  anthranilate synthase component I  21.32 
 
 
522 aa  57.4  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.970752  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3667  Anthranilate synthase  20 
 
 
497 aa  57.4  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1117  anthranilate synthase component I  21.96 
 
 
468 aa  57  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3481  anthranilate synthase component I  22.78 
 
 
491 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0977  p-aminobenzoate synthetase, component I  22.09 
 
 
455 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000344028  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0761  anthranilate synthase component I  23.94 
 
 
539 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.061947  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  23.57 
 
 
409 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2450  anthranilate synthase component I  21.85 
 
 
546 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51360  anthranilate synthase component I  22.14 
 
 
530 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.667979  hitchhiker  0.000188045 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2792  Anthranilate synthase  23.74 
 
 
593 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1136  anthranilate synthase component I  23.6 
 
 
475 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1130  anthranilate synthase component I  23.6 
 
 
475 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.736299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3594  anthranilate synthase component I  20.95 
 
 
503 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4701  para-aminobenzoate synthase component I  20 
 
 
503 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4397  anthranilate synthase component I  22.22 
 
 
491 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1785  anthranilate synthase  20.65 
 
 
505 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3997  anthranilate synthase component I  22.87 
 
 
496 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.346347  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1393  anthranilate synthase component I  23.6 
 
 
472 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000022114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5118  anthranilate synthase component I  22.26 
 
 
492 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2042  anthranilate synthase component I  24.91 
 
 
521 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0906  anthranilate synthase component I  20 
 
 
493 aa  55.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000348371  hitchhiker  0.00000000636534 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2801  anthranilate synthase component I  23.79 
 
 
559 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.790678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>