More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3020 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1928  anthranilate synthase component I  83.21 
 
 
525 aa  862    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.929386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3020  anthranilate synthase component I  100 
 
 
525 aa  1039    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.730737  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3175  anthranilate synthase component I  63.93 
 
 
517 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3400  anthranilate synthase component I  62.99 
 
 
517 aa  596  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28130  anthranilate synthase component I  59.12 
 
 
517 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5714  anthranilate synthase component I  60.19 
 
 
516 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3220  anthranilate synthase component I  59.36 
 
 
498 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1071  anthranilate synthase, component I  63.2 
 
 
485 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.14675  normal  0.387124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5704  anthranilate synthase component I  58.16 
 
 
513 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3078  anthranilate synthase component I  55.89 
 
 
535 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00101032  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1679  anthranilate synthase component I  53.31 
 
 
519 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000133863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1684  anthranilate synthase, component I  53.12 
 
 
528 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.102471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3602  anthranilate synthase component I  54.46 
 
 
508 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148563  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2227  anthranilate synthase component I  53.8 
 
 
520 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2950  anthranilate synthase component I  53.36 
 
 
525 aa  481  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427522  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2814  anthranilate synthase component I  53.83 
 
 
508 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0778236  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14850  anthranilate synthase, component I  53 
 
 
512 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000119125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11625  anthranilate synthase component I  53.88 
 
 
516 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.167744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1992  anthranilate synthase component I  53.99 
 
 
525 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.221966  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0413  anthranilate/para-aminobenzoate synthases component I  50.56 
 
 
518 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.345647  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2044  anthranilate synthase component I  53.04 
 
 
521 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20780  anthranilate synthase, component I  53.86 
 
 
528 aa  465  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3069  anthranilate synthase component I  54.79 
 
 
519 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0340194  normal  0.379754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3053  anthranilate synthase component I  54.6 
 
 
519 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3112  anthranilate synthase component I  54.6 
 
 
519 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1496  anthranilate synthase component I  51.6 
 
 
516 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10930  anthranilate synthase, component I  49.35 
 
 
516 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.108361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  48.83 
 
 
491 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  47.47 
 
 
491 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1212  anthranilate synthase component I  47.52 
 
 
525 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.14858  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  45.91 
 
 
491 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  45.72 
 
 
491 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1042  anthranilate synthase component I  48.63 
 
 
496 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2547  anthranilate synthase component I  45.83 
 
 
491 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000521944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  44.16 
 
 
491 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1162  anthranilate synthase component I  44.38 
 
 
485 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0148  anthranilate synthase component I  43.75 
 
 
501 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0248  anthranilate synthase component I  42.05 
 
 
507 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1582  anthranilate synthase component I  43.98 
 
 
491 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000405168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  44.14 
 
 
494 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  39.62 
 
 
494 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  39.53 
 
 
492 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2860  anthranilate synthase component I  45.18 
 
 
497 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167727  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3481  anthranilate synthase component I  44.25 
 
 
491 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4721  anthranilate synthase, component I  42.31 
 
 
504 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3621  anthranilate synthase component I  44.95 
 
 
497 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0906  anthranilate synthase component I  42.58 
 
 
493 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000348371  hitchhiker  0.00000000636534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3368  anthranilate synthase component I  42.53 
 
 
493 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.082923  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0463  anthranilate synthase component I  45.38 
 
 
497 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612638  normal  0.521627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2571  anthranilate synthase component I  44.75 
 
 
497 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0439  anthranilate synthase component I  45.38 
 
 
497 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.629503  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0534  anthranilate synthase component I  44.75 
 
 
497 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3556  anthranilate synthase component I  45.58 
 
 
522 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3463  anthranilate synthase component I  45.29 
 
 
491 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0715652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3897  anthranilate synthase component I  43.23 
 
 
495 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.839724 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0506  anthranilate synthase component I  44.75 
 
 
497 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.978551 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0533  anthranilate synthase component I  45.58 
 
 
497 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1910  anthranilate synthase component I  45.58 
 
 
522 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3575  anthranilate synthase component I  45.58 
 
 
522 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889198  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0940  anthranilate synthase component I  45.58 
 
 
522 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3583  anthranilate synthase component I  45.58 
 
 
522 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3722  anthranilate synthase component I  45.54 
 
 
491 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.803971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2471  anthranilate synthase, component I  43.69 
 
 
494 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2323  anthranilate synthase, component I  43.3 
 
 
518 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.933209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0644  anthranilate synthase component I  45.58 
 
 
522 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2962  anthranilate synthase component I  44.27 
 
 
505 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00182854  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0761  anthranilate synthase component I  41.67 
 
 
539 aa  372  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.061947  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0162  anthranilate synthase component I  42.34 
 
 
501 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.487235  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3023  anthranilate synthase component I  43.21 
 
 
505 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594824  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2228  anthranilate synthase, component I  44.19 
 
 
521 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3123  anthranilate synthase component I  44.02 
 
 
510 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.274281  normal  0.443979 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0266  anthranilate synthase component I  41.62 
 
 
501 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2909  anthranilate synthase component I  45.38 
 
 
522 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2698  anthranilate synthase component I  44.75 
 
 
497 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0747  anthranilate synthase, component I  41.9 
 
 
493 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3178  anthranilate synthase component I  43.9 
 
 
508 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  44.73 
 
 
489 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2758  anthranilate synthase component I  42.83 
 
 
510 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.654997  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2115  anthranilate synthase, component I  47.4 
 
 
509 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.332687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2362  anthranilate synthase component I  43.27 
 
 
495 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  43.19 
 
 
495 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0356  anthranilate synthase component I  42.75 
 
 
499 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1191  anthranilate synthase component I  43.25 
 
 
487 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00517718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2156  anthranilate synthase component I  43.04 
 
 
517 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.849379  hitchhiker  0.00323016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2369  anthranilate synthase component I  43.69 
 
 
493 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2082  anthranilate synthase component I  45.84 
 
 
491 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0461  anthranilate synthase component I  45.38 
 
 
497 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0366  anthranilate synthase component I  42.75 
 
 
519 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1455  anthranilate synthase component I  42.91 
 
 
514 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.686129 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3496  anthranilate synthase component I  45.38 
 
 
497 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.703327  hitchhiker  0.000325099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2881  anthranilate synthase component I  45.07 
 
 
509 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.889445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  42.52 
 
 
503 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2877  anthranilate synthase component I  43.11 
 
 
489 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2250  anthranilate synthase component I  43.71 
 
 
502 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327103  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1212  anthranilate synthase component I  42.37 
 
 
517 aa  365  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.18446  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  42.86 
 
 
496 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3517  anthranilate synthase component I  41.41 
 
 
495 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0752  anthranilate synthase component I  42 
 
 
499 aa  363  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1251  anthranilate/para-aminobenzoate synthass component I  39.58 
 
 
485 aa  362  9e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3579  anthranilate synthase component I  44.51 
 
 
574 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.736027  normal  0.0487715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>