More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0281 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  98.72 
 
 		 467 aa  954    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 467 aa  965    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  74.68 
 
 		 458 aa  682    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  73.78 
 
 		 474 aa  699    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 468 aa  511  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  53.98 
 
 		 462 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 453 aa  448  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 485 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 459 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 459 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 493 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 481 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 490 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 456 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 459 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000240351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 486 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0154063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 454 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 460 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 464 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0120  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4063  cysteinyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 462 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 460 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 486 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 472 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>